文建凡 博士 中国科学院昆明动物研究所研究员(二级) 博士生导师
现任“遗传资源与进化国家重点实验室”副主任,“真核细胞进化基因组学学科组”学科带头人;享受国务院特殊津贴专家,中科院“西部之光”人才,云南省“中青年学术与技术带头人”,云南省青年科技奖获得者,省委联系专家。现担任中国细胞生物学学会资深理事、中国动物学会原生动物学分会副理事长、云南省细胞生物学学会理事长;国家自然科学基金委二审评委,国家高层次人才培养支持计划评委;Mol Biol Evol、BMC Evol Biol、BMC Genomics、Parasitol Res、J Eukar Microbiol 等审稿人;《中国细胞生物学学报》、《生命科学研究》等编委。
1996.8于中科院昆明动物研究所获动物学博士。1989.12于中科院昆明动物研究所获细胞生物学硕士。1986.7 于湖南师范大学生物系获理学学士。
主要以处在关键进化地位的单细胞原生生物(Protist)(包括原生动物如贾第虫(Giardia) 和藻类(如衣藻、眼虫等))为研究对象,向下追溯到原核生物,向上拓展到多细胞生物,开展真核细胞的结构和功能,尤其是基因、基因家族、代谢途径和基因组的多样性及其演化的研究。旨在从进化的视角阐明真核细胞为什么具有如此这般的精细结构和精妙的功能活动机制,它们是如何从原核细胞进化而来,又怎样从单细胞进化成多细胞的,以及真核细胞的进化如何为后续的生物多样性和复杂性的形成和大发展奠定基础的。以期达到对真核细胞本身乃至由其所构建的真核生物的认识从“知其然”深化到“知其所以然”的境界。同时,对一些原生生物的特殊适应性(如寄生适应性(parasitic adaptation)、代谢适应性(metabolic adaptation)和营养方式适应性(trophic adaptation))和适应性辐射的细胞、分子和遗传机理进行深入研究,揭示其适应性进化的规律和机制,并从中发掘寄生原虫的防治靶标和一些可用于微藻工程的特异基因和代谢途径。近年来,还重点基于贾第虫的极小基因组开展真核细胞简约基因组(Minimal Genome)和底盘细胞(Chassis Cell)的构建,以及基于衣藻的混合营养机制进行微藻的基因组编辑研究,旨在构建具有基础研究价值和应用前景的真核底盘细胞和具有高效混合营养的工程藻株,为合成生物学的研究和应用提供重要基础。
主持了包括国家基金重点项目、科技部973课题、中科院重要方向和云南省重点项目等科研项目50余项。在Mol Biol Evol、Cell Res、Biol Cell、Genome Biol Evol、BMC Genomics等在内的本领域重要学术刊物上发表学术论文70余篇。有3项研究成果获得省部级科技成果奖。已培养硕士32名(其中毕业获学位17名,转为博士生14名,在学硕士生1名)、博士研究生19名(其中毕业获学位17名,在读博士生2名)
电子邮件:wenjf@mail.kiz.ac.cn
联系电话:0871-65198682
通信地址:云南省昆明市盘龙区龙欣路17号中国科学院昆明动物研究所
邮政编码:650201
研究领域
真核细胞的进化基因组学
旨在从分子和细胞两个层次上探讨真核细胞的结构、功能和基因、基因组在不同进化地位生物中的多样性及其进化形成的规律和机制。主要以一系列处在关键进化地位的单细胞原生动物(如贾第虫)和藻类(如单细胞绿藻、裸藻等)为研究对象,向下追溯到原核生物,向上扩展到多细胞生物,利用细胞、分子、生化、多种组学、生物信息学和进化生物学等多学科技术手段开展如下方面的研究:1)真核细胞的重要结构(如核骨架、核纤层、染色质和核仁等)的多样性与进化;2)真核细胞重要功能活动机制(如细胞核分裂、蛋白质定向转运系统、各种代谢途径如糖酵解、三羧酸循环、糖卡尔文循环、糖异生及脂类代谢等)的多样性与进化;3)与前二者相关的重要基因、基因家族、功能途径基因群和亚基因组(如核仁基因组)的多样性与进化问题; 4)一些生物的特殊适应性和适应性射的细胞、分子和基因组基础,并从中发掘有害生物(如寄生虫等)的特异性防治靶标和开发利用藻类的高效、特殊的生物代谢途径用于藻类工程和合成生物学。已取得的主要业绩有:1)确立了贾第虫(Giardia)为代表的双滴虫类在真核生物早期进化中的重要地位,重估了其在进化生物学的重要研究价值;2)揭示了血吸虫和贾第虫等的一些寄生适应性的分子机制,发现了一些潜在的特异防治寄生虫的分子靶标;3)否定了“衣藻-团藻”这一单细胞进化成多细胞生物的传统进化模型,揭示了衣藻混合营养(mixotrophy)的精巧代谢机制,后者可为微藻工程和合成生物学提供基础和资源,具十分诱人的应用前景。
近来,重点基于某些原生生物的极小基因组和特殊的代谢途径开展简约基因组和底盘细胞的构建等合成生物学研究,旨在构建具有基础研究价值和广泛应用前景的真核底盘和具有高效混合营养的工程藻株,正在取得重要进展。
招生信息
招生专业
071022-基因组学
招生方向
分子细胞生物学
教育背景
学历
博士研究生
学位
理学博士
工作经历
2001.11 - 至今,中国科学院昆明动物研究所,研究员,具体研究工作:原生动物与藻类的基因组、代谢途径的适应性进化与合成生物学研究
1995.11 - 2001.11,中国科学院昆明动物研究所,副研究员,具体研究工作:原生动物与藻类的基因、代谢途径及适应性进化研究
1992.12 - 1995.11,中国科学院昆明动物研究所,助理研究员,具体研究工作:原生动物与藻类的细胞生物学研究
1989.12 - 1992.12,中国科学院昆明动物研究所,研究实习员,具体研究工作:原生动物与藻类的细胞生物学研究
工作简历
学术兼职
2013-12-01-今,云南省细胞生物学学会, 理事长
2009-04-01-今,中国细胞生物学学会, 理事、常务理事、资深理事
2007-12-24-今,云南省政协委员, 第十~十二届委员会委员
2007-11-01-2017-11-30,中国民主同盟中央委员, 第十~十一届中央委员会委员
2007-07-01-2017-06-30,中国民主同盟云南省省委委员, 第十二~十三届委员会委员
1997-07-01-2002-07-01,中国细胞生物学学会第七届常务理事,细胞核与染色体专业委员会副主任委员,
教授课程
专利与奖励
奖励信息
出版信息
发表论文
科研活动
科研项目
参与会议
指导学生
已指导学生
张国莉 博士研究生 071002-动物学
辛德东 博士研究生 071002-动物学
孙桂玲 博士研究生 071002-动物学
董玖红 博士研究生 071002-动物学
秦燕 博士研究生 071002-动物学
田海峰 博士研究生 071002-动物学
孙隽 博士研究生 071002-动物学
徐健 博士研究生 071002-动物学
陈兵 博士研究生 071002-动物学
阳春林 硕士研究生 071009-细胞生物学
江永海 硕士研究生 071009-细胞生物学
潘绍云 硕士研究生 071009-细胞生物学
陈利辉 硕士研究生 071009-细胞生物学
张玉娟 博士研究生 071009-细胞生物学
张燕琼 硕士研究生 071009-细胞生物学
申浩 硕士研究生 071009-细胞生物学
唐丹 硕士研究生 071009-细胞生物学
邹勇 硕士研究生 071009-细胞生物学
程菁菁 硕士研究生 071009-细胞生物学
倪婷 硕士研究生 071009-细胞生物学
冯金梅 博士研究生 071009-细胞生物学
汪德勇 博士研究生 071009-细胞生物学
王文敏 硕士研究生 071009-细胞生物学
谢钢琴 硕士研究生 071009-细胞生物学
李毓劲 博士研究生 071009-细胞生物学
姚友旭 硕士研究生 085238-生物工程
叶青青 博士研究生 071009-细胞生物学
薛敏 博士研究生 071007-遗传学
邱兰 硕士研究生 085238-生物工程
吕章夏 博士研究生 071009-细胞生物学
现指导学生
程姣妮 博士研究生 071009-细胞生物学
邓琪 博士研究生 071009-细胞生物学