071007-遗传学

遗传学和进化基因组学
肿瘤基因组学
基因组计算

1977-09--1982-06   加拿大英属哥伦比亚大学   博士
1972-09--1976-06   台湾东海大学   学士

   

2008-06~现在, 中国科学院北京基因组研究所, 所长
1998-07~现在, 美国芝加哥大学, 教授
1998-07~2006-06,美国芝加哥大学, 生态与进化系主任
1991-07~1998-06,美国芝加哥大学, 副教授
1990-09~1991-06,美国罗彻斯特大学, 副教授
1986-08~1990-08,美国罗彻斯特大学, 助理教授
1985-01~1986-07,美国威斯康星麦迪逊分校, 博士后
1982-06~1984-12,美国德克萨斯大学休斯顿健康中心, 博士后
1977-09~1982-06,加拿大英属哥伦比亚大学, 博士
1972-09~1976-06,台湾东海大学, 学士

2013-01-01-今,NCBI Scientific Counsellor,
2013-01-01-今,加利福尼亚大学旧金山分校Ajunct Perfessor,
2013-01-01-今,NCBI Member of Advisor Board,
2004-09-01-今,美国科学促进会(AAAS)会士,
2004-07-01-今,台湾中央研究院院士,
2004-07-01-今,中山大学长江学者讲座教授,
2004-01-01-2008-12-31,日本国立遗传研究所特聘教授,

进化生物学
人类基因组学研究-进展与应用

   

（ 1 ） 以痕量DNA为基础的二代测序文库构建方法, 2016, 第 5 作者, 专利号: ZL201410158326.7

（ 2 ） 用于恶性肿瘤治疗的组合物及其应用, 2013, 第 5 作者, 专利号: ZL 2012 1 0046682.0

（ 3 ） 筛选肿瘤早期诊断靶标的Small RNA-seq库的构建方法, 2013, 第 5 作者, 专利号: ZL 2012 1 0041472.2

   

（1） Ultra-precise detection of mutations by droplet-based amplification of circularized DNA, BMC Genomics, 2016, 通讯作者
（2） Using ultra-sensitive next generation sequencing to dissect DNA damage-induced mutagenesis, Scientific Reports, 2016, 通讯作者
（3） Functional conservation of both CDS- and 3’UTR- located miRNA binding sites between species, Molecular biology and evolution, 2015, 通讯作者
（4） Extremely high genetic diversity in a single tumor points to prevalence of non-Darwinian cell evolution, PNAS, 2015, 通讯作者
（5） New microRNAs in Drosophila--birth, death and cycles of adaptive evolution, PLoS genetics, 2014, 通讯作者
（6） The evolution of small insertions and deletions in the coding genes of drosophila melanogaster, Molecular biology and evolution, 2013, 通讯作者
（7） *. The evolution of evolvability in microrna target sites in vertebrates, Genome research, 2013, 通讯作者
（8）  Identification of medium-sized genomic deletions with low coverage, mate-paired restricted tags, BMC Genomics., 2013, 通讯作者
（9） Age-dependent transition from cell-level to population-level contraol in murine intestinal homeostasis revealed by coalescence analysis, PloSGentics, 2013, 通讯作者
（10） The genomics of selection in dogs and the parallel evolution between dogs and humans., Nature Comm, 2013, 通讯作者
（11） Rainbow: an integrated tool for e cient clustering and assembling RAD-seq reads,  Bioinformatics , 2012, 通讯作者
（12）  , Incompatibility and Competitive Exclusion of Genomic Segments between Sibling Drosophila Species. , PloSGentics, 2012, 通讯作者
（13）  Two evolutionary histories in the genome of rice: the roles of domestication genes, PLoS Genet., 2011, 通讯作者
（14） Population genetics in non-model organisms: II. Natural selection in marginal habitats revealed by deep sequencing on dual platforms, Molecular Biology and Evolution, 2011, 通讯作者
（15） Rapid growth of a hepatocellular carcinoma and the driving mutations revealed by a cell-population genetic analysis of whole-genome data, PNAS, 2011, 通讯作者
（16） Sex, sex chromosome and gene expression, BMC Biol, 2011, 通讯作者
（17） Adverse interactions between micro-RNAs and target genes from different species, PNAS, 2010, 通讯作者
（18） Genome-wide misexpression of X-linked vs.autosomal genes associated with hybrid male sterility, Genome Res, 2010, 通讯作者
（19） Evolution under canalization and the dual roles of microRNAs-A hypothesis, Genome Res, 2009, 第 1 作者
（20） Adverse Independent losses of function in a polyphenol oxidase in rice: differentiation in grain discoloration between subspecies and the role of positive selection under domestication, The Plant Cell Online , 2008, 通讯作者

   

（ 1 ） MicroRNAs的功能进化分析与全基因组表达稳定性的渠化调控, 负责人, 国家任务, 2012-01--2016-12
（ 2 ） 肿瘤微进化和第二代肿瘤基因组学, 负责人, 中国科学院计划, 2013-01--2015-12
（ 3 ） 微机化的多基因作用机制专家指导费, 负责人, 国家任务, 2013-03--2015-03
（ 4 ） 细胞逐步适应新环境的多基因作用机制, 负责人, 国家任务, 2013-01--2016-12
（ 5 ） 肿瘤异质性的分子网络研究和新治疗策略, 负责人, 国家任务, 2014-01--2018-08