基本信息
吴立刚  男  博导  中国科学院分子细胞科学卓越创新中心
电子邮件: lgwu@sibcb.ac.cn
通信地址: 上海市岳阳路320号
邮政编码: 200031

研究领域

(1) mRNA和小RNA调控的分子机制。
(2) RNA药物的设计与开发。
(3) 新的高通量测序方法开发及其在疾病诊疗中的应用。


招生信息

招收博士生和硕士生。

招生专业
071010-生物化学与分子生物学
086000-生物与医药
招生方向
非编码RNA的分子机制及其应用
RNA药物设计
单细胞测序

教育背景

1996-09--2001-06   中国科学院上海植物生理研究所   博士研究生
1992-09--1996-06   上海交通大学   本科
学历

研究生


学位
博士

工作经历

2001年至2008年在美国纽约大学(NYU)医学院从事博士后研究。2008年10月起任中科院上海生科院生化与细胞所研究员,“****”入选者。


工作简历
2020-05~现在, 中国科学院分子细胞卓越创新中心, 研究员
2008-06~2020-04,中国科学院上海生命科学研究院,生物化学与细胞生物学研究所, 研究员
2001-12~2008-06,美国纽约大学, 博士后
社会兼职
2020-06-01-2024-05-31,生命的化学杂志第九届编委会, 委员
2016-11-01-2020-10-31,中国生物化学与分子生物学RNA专业委员会, 理事

专利与奖励

新型RNAi前体及其制备和应用, 发明, 2017, 第 1 作者, 专利号: 201310068534.3


专利成果
[1] 李典范, 李婷婷, 李艳芳, 赖燕玲, 姚贺帮, 蔡洪敏, 劳蒂米, 周冰洁, 赵雅佩, 孟飞龙, 毕玉海, 刘浏, 张宁, 王燕燕, 龚玉环, 陈剑峰, 吴立刚, 许琛琦, 周海生, 陈珺芳, 孔庆鑫, 孙昼, 李钧, 张学潮. :一种抗新型冠状病毒SARS-CoV-2的抗体及其制备方法和用途. 2020114079067, 2020-12-04.

[2] 吴立刚, 尚仁福. 可诱导型siRNA表达载体及其制备和应用. CN: CN107557363A, 2018-01-09.

[3] 吴立刚, 杨其元. 测序文库构建中5’和3’接头连接副产物的去除方法. CN: CN107488655A, 2017-12-19.

[4] 吴立刚, 尚仁福, 徐蓓英. 新型RNAi前体及其制备和应用. CN: CN104031916B, 2017-06-06.

出版信息

   
发表论文
(1) Extracellular vesicle long RNA markers of early-stage lung adenocarcinoma, INTERNATIONAL JOURNAL OF CANCER, 2023, 通讯作者
(2) Genome-wide DNA methylation profiles and small noncoding RNA signatures in sperm with a high DNA fragmentation index, JOURNAL OF ASSISTED REPRODUCTION AND GENETICS, 2022, 通讯作者
(3) Exosome Mediated Cytosolic Cisplatin Delivery Through Clathrin-Independent Endocytosis and Enhanced Anti-cancer Effect via Avoiding Endosome Trapping in Cisplatin-Resistant Ovarian Cancer, FRONTIERS IN MEDICINE, 2022, 通讯作者
(4) Ageing induces tissue-specific transcriptomic changes in Caenorhabditis elegans, EMBO JOURNAL, 2022, 通讯作者
(5) The piRNA pathway is essential for generating functional oocytes in golden hamsters, NATURE CELL BIOLOGY, 2021, 通讯作者
(6) Identifying Cleaved and Noncleaved Targets of Small Interfering RNAs and MicroRNAs in Mammalian Cells by SpyCLIP, MOLECULAR THERAPY-NUCLEIC ACIDS, 2020, 通讯作者
(7) Regeneration-Related Functional Cargoes in Mesenchymal Stem Cell-Derived Small Extracellular Vesicles, STEM CELLS AND DEVELOPMENT, 2020, 通讯作者
(8) SpyCLIP: an easy-to-use and high-throughput compatible CLIP platform for the characterization of protein–RNA interactions with high accuracy, NUCLEIC ACIDS RESEARCH, 2019, 通讯作者
(9) NaIO4氧化–深度测序技术的优化用于检测微量RNA样品中小RNA 3′末端甲基化修饰, An Improved NaIO4 Oxidation and Deep-Sequencing Method for Detecting 3′Terminal Methylation of Small RNAs in Low-Input RNA Samples, 中国细胞生物学学报, 2019, 第 4 作者
(10) Identification of small non-coding RNAs as sperm quality biomarkers for in vitro fertilization, CELL DISCOVERY, 2019, 通讯作者
(11) Evolution of an X-Linked miRNA Family Predominantly Expressed in Mammalian Male Germ Cells, MOLECULAR BIOLOGY AND EVOLUTION, 2019, 通讯作者
(12) Single-cell CAS-seq reveals a class of short PIWI-interacting RNAs in human oocytes, NATURE COMMUNICATIONS, 2019, 通讯作者
(13) Identification of substrates of the small RNA methyltransferase Hen1 in mouse spermatogonial stem cells and analysis of its methyl-transfer domain, JOURNAL OF BIOLOGICAL CHEMISTRY, 2018, 通讯作者
(14) Structural insights into the sequence-specific recognition of Piwi by Drosophila Papi, PROCEEDINGS OF THE NATIONAL ACADEMY OF SCIENCES OF THE UNITED STATES OF AMERICA, 2018, 第 8 作者
(15) Human Virus-Derived Small RNAs Can Confer Antiviral Immunity in Mammals, IMMUNITY, 2017, 其他(合作组作者)
(16) Distinct Expression Profiles and Novel Targets of MicroRNAs in Human Spermatogonia, Pachytene Spermatocytes, and Round Spermatids between OA Patients and NOA Patients, MOLECULAR THERAPY-NUCLEIC ACIDS, 2017, 第 9 作者
(17) Profiling of miRNAs in porcine germ cells during spermatogenesis, REPRODUCTION, 2017, 第 9 作者
(18) Ubiquitination-Deficient Mutations in Human Piwi Cause Male Infertility by Impairing Histone-to-Protamine Exchange during Spermiogenesis, CELL, 2017, 第 13 作者
(19) Telomeric TERB1-TRF1 interaction is crucial for male meiosis, NATURE STRUCTURAL & MOLECULAR BIOLOGY, 2017, 第 6 作者
(20) Highly sensitive sequencing reveals dynamic modifications and activities of small RNAs in mouse oocytes and early embryos, SCIENCE ADVANCES, 2016, 通讯作者
(21) YTHDF2 destabilizes m 6 A-containing RNA through direct recruitment of the CCR4–NOT deadenylase complex, NATURE COMMUNICATIONS, 2016, 通讯作者
(22) Correction of a genetic disease by CRISPR-Cas9-mediated gene editing in mouse spermatogonial stem cells, CELL RESEARCH, 2015, 第 20 作者
(23) Ribozyme-enhanced single-stranded Ago2-processed interfering RNA triggers efficient gene silencing with fewer off-target effects, NATURE COMMUNICATIONS, 2015, 通讯作者
(24) MicroRNA-mediated repression of nonsense mRNAs, ELIFE, 2014, 通讯作者
(25) CCR4-NOT deadenylates RISC-associated mRNA in human cells., Mol Cell Biol, 2010, 通讯作者
(26) Examining the influence of microRNA on translation and mRNA decay., Methods in Enzymology, 2008, 第 1 作者
(27) Let Me Count the Ways: Mechanisms of Gene Regulation by miRNAs and siRNAs, MOLECULAR CELL, 2008, 第 1 作者
(28) MicroRNAs direct rapid deadenylation of mRNA, PROCEEDINGS OF THE NATIONAL ACADEMY OF SCIENCES OF THE UNITED STATES OF AMERICA, 2006, 
(29) Micro-RNA Regulation of the Mammalian lin-28 Gene during Neuronal Differentiation of Embryonal Carcinoma Cells, MOLECULAR AND CELLULAR BIOLOGY, 2005, 
(30) Importance of translation and non-nucleolytic Ago proteins for on-target RNA interference, CURRENTBIOLOGYCB, 第 1 作者

科研活动

   
科研项目
( 1 ) 炎症诱导肿瘤中的miRNA调控网络研究, 负责人, 国家任务, 2012-01--2016-08
( 2 ) 单链saRNA加工和抑制效率的研究, 负责人, 国家任务, 2015-01--2018-12
( 3 ) 非编码小RNA在受精卵发育中的降解和功能调控机制, 负责人, 国家任务, 2015-01--2017-12
( 4 ) 高通量高内涵分析方法, 负责人, 中国科学院计划, 2016-06--2021-05
( 5 ) 小 RNA-蛋白质机器在哺乳动物精子发生中的功能和机制, 参与, 国家任务, 2017-06--2022-05
( 6 ) 干细胞命运决定过程中胞核无膜颗粒小体的结构、定位、组成成分及其动态变化研究, 参与, 国家任务, 2021-12--2026-06
( 7 ) 吴立刚万人计划领军, 负责人, 国家任务, 2021-01--2023-12
( 8 ) 非编码RNA在配子发生及生殖障碍中的功能机制, 参与, 国家任务, 2022-12--2027-11
参与会议
(1)gRNA dependent and gRNA independent off-target binding activities of dCas13   冷泉港亚洲系列会议核糖核酸治疗的现在和未来   2023-06-19
(2)piRNAs are essential for female fertility in golden hamsters   2022-04-25
(3)piRNAs are essential for female fertility in golden hamsters   2022-04-06
(4)piRNA pathway is essential for generating functional oocytes in golden hamster   第十一届全国核糖核酸学术讨论会   2021-07-02
(5)piRNAs are essential for female fertility in golden hamsters   中国生物化学与分子生物学会2019 年全国学术会议   2019-10-24
(6)A novel class of 20-nucleotide piRNA predominantly expressed in human and monkey oocytes   第十届全国核糖核酸(RNA)学术讨论会会议   2018-06-15
(7)Sequencing Small RNAs in Mouse Oocytes and Early Embryos   第十一届华人生物家协会会议   2016-07-29
(8)Profiling of Small Noncoding RNAs in Mouse Oocyte and Early Embryos   中国细胞生物学学会2015年全国学术大会   2015-04-02
(9)MicroRNA Serves as mRNA Surveillance System to Eliminate Nonsense mRNA   2014年冷泉港亚洲   2014-11-11
(10)MicroRNAs Serve as mRNA Surveillance System to Eliminate Nonsense Messages   第10届海峡两岸细胞生物学学术研讨会   2014-04-22

指导学生

已指导学生

张英  博士研究生  071010-生物化学与分子生物学  

赵雅  博士研究生  071010-生物化学与分子生物学  

朴香花  博士研究生  071010-生物化学与分子生物学  

尚仁福  博士研究生  071010-生物化学与分子生物学  

崔峪  博士研究生  071010-生物化学与分子生物学  

胡思达  硕士研究生  071010-生物化学与分子生物学  

林济民  硕士研究生  071010-生物化学与分子生物学  

杨其元  博士研究生  071010-生物化学与分子生物学  

杜好  博士研究生  071010-生物化学与分子生物学  

张凤娟  博士研究生  071010-生物化学与分子生物学  

张宏道  博士研究生  071010-生物化学与分子生物学  

滕怡兰  硕士研究生  085238-生物工程  

吕小龙  博士研究生  071010-生物化学与分子生物学  

周文涛  博士研究生  071010-生物化学与分子生物学  

水心稼  博士研究生  071010-生物化学与分子生物学  

冯欢欢  博士研究生  071010-生物化学与分子生物学  

刘伟  博士研究生  071010-生物化学与分子生物学  

曹颖  博士研究生  071010-生物化学与分子生物学  

卢城江  博士研究生  071010-生物化学与分子生物学  

王端端  硕士研究生  085238-生物工程  

高世琦  硕士研究生  086000-生物与医药  

现指导学生

黎硕珂  博士研究生  071010-生物化学与分子生物学  

周海生  博士研究生  071010-生物化学与分子生物学  

肖稳  博士研究生  071010-生物化学与分子生物学  

李志学  硕士研究生  071010-生物化学与分子生物学  

赵震  硕士研究生  086000-生物与医药  

常允建  博士研究生  071010-生物化学与分子生物学  

张一凡  硕士研究生  071009-细胞生物学  

郑玉丽  硕士研究生  071009-细胞生物学  

李玉玺  硕士研究生  086000-生物与医药  

朱懿文  硕士研究生  086000-生物与医药