071005-微生物学
086000-生物与医药

微生物资源发掘及应用
微生物发酵与代谢调控
环境微生物学

2016-07--2016-10   美国奥本大学   访问学者
2001-09--2006-06   四川大学   硕博连读/研究生、博士学位

   

2016-07~2016-10,美国奥本大学, 访问学者
2009-01~现在, 中国科学院成都生物研究所, 副研究员
2006-07~2009-01,中国科学院成都生物研究所, 助理研究员
2001-09~2006-06,四川大学, 硕博连读/研究生、博士学位

2011-06-05-2014-05-05,应用与环境微生物学报, 英文编辑
2009-05-10-2012-05-10,环境科学与技术, 特约编委

   

（ 1 ） 一种微生物共培养催化碳水化合物合成己酸的方法, 2021, 第 1 作者, 专利号: CN110004202B

（ 2 ） 一种有机废弃物资源化处理方法, 2020, 第 2 作者, 专利号: CN107363076B

（ 3 ） 一种镉污染土壤复合钝化剂及其应用, 2019, 第 2 作者, 专利号: CN110252803A

（ 4 ） 一种酿酒黄水资源化利用的方法, 2018, 第 1 作者, 专利号: CN108330044A

（ 5 ） 一种酿酒黄水资源化利用的方法, 2018, 第 1 作者, 专利号: CN108330044A

（ 6 ） 一种镉污染稻田土壤微生物钝化剂, 2017, 第 1 作者, 专利号: CN107488620A

（ 7 ） 一种中链脂肪酸己酸的提取方法, 2017, 第 5 作者, 专利号: CN107382708A

（ 8 ） 一株瘤胃菌及其应用, 2017, 第 1 作者, 专利号: CN106834177A

（ 9 ） 一种新的乳酸利用梭菌及其用途, 2016, 第 2 作者, 专利号: CN105586293A

（ 10 ） 利用乳酸产己酸的瘤胃梭菌及其用途, 2016, 第 2 作者, 专利号: CN105420168A

（ 11 ） 一种通过微生物催化乳酸合成己酸的方法, 2015, 第 1 作者, 专利号: CN104357496A

（ 12 ） 一种硫酸亚铁生物资源化处理方法, 2013, 第 5 作者, 专利号: CN103305553A

（ 13 ） 一种利用生物电化学系统还原二氧化碳生产甲烷和乙酸的方法, 2013, 第 4 作者, 专利号: CN102925492A

（ 14 ） 一种改善氧化铁超细粉体水性分散性的微生物学方法, 2012, 第 5 作者, 专利号: CN102826611A

（ 15 ） 一种户用气调贮粮系统及方法, 2012, 第 4 作者, 专利号: CN102812826A

（ 16 ） 一种快速启动铁氧化菌活性的细胞培养方法, 2012, 第 3 作者, 专利号: CN102796689A

（ 17 ） 利用电流生长的硫酸盐还原菌处理重金属废水的方法, 2012, 第 4 作者, 专利号: CN102642930A

（ 18 ） 一种垃圾渗滤液脱氮并抑制甲烷排放的方法, 2012, 第 1 作者, 专利号: CN102464435A

（ 19 ） 一种生物电化学偶联脱氮装置和方法, 2012, 第 2 作者, 专利号: CN102372393A

（ 20 ） 一种生物电化学脱氮反应器及其使用方法, 2012, 第 3 作者, 专利号: CN102351312A

（ 21 ） 一种微生物燃料电池及其制备方法, 2011, 第 5 作者, 专利号: CN102255096A

（ 22 ） 一种自养异养共生氨氧化菌剂、其培养方法及用途, 2010, 第 2 作者, 专利号: CN101831392A

（ 23 ） 一种生物质发酵-光合耦联产氢的方法, 2010, 第 3 作者, 专利号: CN101760479A

（ 24 ） 一株假单胞菌及其在生物还原和生物吸附中的用途, 2009, 第 3 作者, 专利号: CN101531970A

   

（1） 基因编辑技术在产溶剂梭菌中的应用, 应用与环境生物学报, 2023, 第 3 作者
（2） Microbial Ecological Mechanism for Long-Term Production of High Concentrations of n-Caproate via Lactate-Driven Chain Elongation, APPLIED AND ENVIRONMENTAL MICROBIOLOGY, 2021, 第 7 作者
（3） Genome-Wide Transcriptomic Analysis of n-Caproic Acid Production in Ruminococcaceae Bacterium CPB6 with Lactate Supplementation, J. Microbiol. Biotechnol., 2021, 通讯作者
（4） Butyryl/Caproyl-CoA:Acetate CoA-transferase: cloning, expression and characterization of the key enzyme involved in medium-chain fatty acid biosynthesis, Bioscience Reports, 2021, 通讯作者
（5） 瘤胃菌与乳酸菌共培养利用葡萄糖合成己酸, Caproic acid production from glucose via the co-culture of Ruminococcaceae bacterium CPB6 and Lactobacillus plantarum RJ25, 应用与环境生物学报, 2021, 第 3 作者
（6） Transcriptional response ofPseudomonas chenduensisstrain MBR to cadmium toxicity, APPLIED MICROBIOLOGY AND BIOTECHNOLOGY, 2020, 通讯作者
（7） Cloning and characterization of a l-lactate dehydrogenase gene from Ruminococcaceae bacterium CPB6, WORLD JOURNAL OF MICROBIOLOGY & BIOTECHNOLOGY, 2020, 通讯作者
（8） Dynamics and potential roles of abundant and rare subcommunities in the bioremediation of cadmium-contaminated paddy soil by Pseudomonas chenduensis, APPLIED MICROBIOLOGY AND BIOTECHNOLOGY, 2019, 通讯作者
（9） Effects of Pseudomonas chenduensis and biochar on cadmium availability and microbial community in the paddy soil, SCIENCE OF THE TOTAL ENVIRONMENT, 2018, 通讯作者
（10） Improvement of n-caproic acid production with Ruminococcaceae bacterium CPB6: selection of electron acceptors and carbon sources and optimization of the culture medium, MICROBIAL CELL FACTORIES, 2018, 通讯作者
（11） Production of high-concentration n-caproic acid from lactate through fermentation using a newly isolated Ruminococcaceae bacterium CPB6, BIOTECHNOLOGY FOR BIOFUELS, 2017, 通讯作者
（12） The process-related dynamics of microbial community during a simulated fermentation of Chinese strong-flavored liquor, BMC MICROBIOLOGY, 2017, 通讯作者
（13） The functional potential and active populations of the pit mud microbiome for the production of Chinese strong-flavour liquor, MICROBIAL BIOTECHNOLOGY, 2017, 第 1 作者
（14） Complete genome sequence of Ruminococcaceae bacterium CPB6: A newly isolated culture for efficient n-caproic acid production from lactate, JOURNAL OF BIOTECHNOLOGY, 2017, 第 1 作者
（15） Production of Butyrate from Lactate by a Newly Isolated Clostridium sp. BPY5, APPLIED BIOCHEMISTRY AND BIOTECHNOLOGY, 2016, 第 1 作者
（16） Production of Butyrate from Lactate by a Newly Isolated Clostridium sp BPY5, APPLIED BIOCHEMISTRY AND BIOTECHNOLOGY, 2016, 通讯作者
（17） 一株新的毛螺旋菌-BTY6的分离与鉴定, Isolation and identification of a new Lachnospiraceae bacterium BTY6, 四川大学学报：自然科学版, 2016, 第 3 作者
（18） 乳酸合成丁酸的工艺构建及其条件优化, 应用与环境生物学报, 2016, 第 3 作者
（19） Clostridium liquoris sp. nov., isolated from a fermentation pit used for the production of Chinese Strong-Flavored Liquor., Int J Syst Evol Microbiol., 2016, 通讯作者
（20） Microorganism-regulated mechanisms of temperature effects on the performance of anaerobic digestion, MICROBIAL CELL FACTORIES, 2016, 第 5 作者
（21） 浓香型白酒窖泥中优势菌群的定量PCR分析, Detection of dominant prokaryotes in pit mud of Chinese strong-flavor liquor based on qPCR, 应用与环境生物学报, 2015, 第 3 作者
（22） The synthesis of n-caproate from lactate: a new efficient process for medium-chain carboxylates production, SCIENTIFIC REPORTS, 2015, 通讯作者
（23） Promotion of Ni2+ Removal by Masking Toxicity to Sulfate-Reducing Bacteria: Addition of Citrate, INTERNATIONAL JOURNAL OF MOLECULAR SCIENCES, 2015, 通讯作者
（24） Prokaryotic Communities in Pit Mud from Different-Aged Cellars Used for the Production of Chinese Strong-Flavored Liquor, APPLIED AND ENVIRONMENTAL MICROBIOLOGY, 2014, 第 1 作者
（25） 浓香型白酒窖泥中细菌和古菌的组成与多样性, Microbial community compositions and diversity in pit mud of Chinese Luzhou-flavor liquor, 化工学报, 2014, 第 1 作者
（26） Ammonia as carbon-free substrate for hydrogen production in bioelectrochemical systems, INTERNATIONAL JOURNAL OF HYDROGEN ENERGY, 2014, 第 3 作者
（27） Anodic ammonia oxidation to nitrogen gas catalyzed by mixed biofilms in bioelectrochemical systems, ELECTROCHIMICA ACTA, 2014, 第 3 作者
（28） 生物电化学系统固定二氧化碳同时产生乙酸和丁酸, Simultaneous microbial electrosynthesis of acetate and butyrate from carbon dioxide in bioelectrochemical systems, 应用与环境生物学报, 2014, 第 5 作者
（29） Pseudomonas chengduensis sp nov., isolated from landfill leachate, INTERNATIONAL JOURNAL OF SYSTEMATIC AND EVOLUTIONARY MICROBIOLOGY, 2014, 第 1 作者
（30） 硫酸粘菌素生产废水的硝化反硝化生物脱氮, 应用与环境生物学报, 2013, 第 5 作者
（31） 高浓度氨氮废水短程硝化及氨氧化菌群分析, Shortcut Nitrification of High Ammonia Concentration Wastewater and Ammonia-oxidizing Bacterial Community, 应用与环境生物学报, 2013, 第 3 作者
（32） Presence of Fe3+ and Zn2+ promoted biotransformation of Cd–citrate complex and removal of metals from solutions, JOURNAL OF HAZARDOUS MATERIALS, 2013, 第 2 作者
（33） 生物电化学系统还原二氧化碳同时合成甲烷和乙酸, 应用与环境生物学报, 2013, 第 4 作者
（34） 光合细菌对水产养殖环境细菌群落结构的影响, Effect of photosynthetic bacteria on bacterial communities in aquaculture water and sediment by PCR- DGGE analysis, 淡水渔业, 2013, 第 4 作者
（35） Bioelectrochemical systems for simultaneously production of methane and acetate from carbon dioxide at relatively high rate, INTERNATIONAL JOURNAL OF HYDROGEN ENERGY, 2013, 第 5 作者
（36） 变形虫Naegleria sp. TH8的分离鉴定及食藻特性的初步研究, 应用与环境生物学报, 2012, 通讯作者
（37） Dissimilatory nitrate reduction by Pseudomonas alcaliphila with an electrode as the sole electron donor, BIOTECHNOLOGYANDBIOENGINEERING, 2012, 第 6 作者
（38） 变形虫Naegleria sp.TH8的分离鉴定及食藻特性, Identi fication and Herbivory Characteristics of Naegleria sp. TH8, 应用与环境生物学报, 2012, 第 4 作者
（39） Sulfate reduction with electrons directly derived from electrodes in bioelectrochemical systems, ELECTROCHEMISTRY COMMUNICATIONS, 2012, 第 3 作者
（40） 氮磷胁迫下藻-菌群落的变化研究, Variation of Algal-bacterial Community under Nitrogen-Phosphorus Stress, 环境科学与技术, 2012, 第 3 作者
（41） 假单胞菌MBR还原钛（Ⅳ）合成钛纳米粒子, Reduction of Ti(Ⅳ) and Synthesis of Titanium Nanoparticles by Pseudomonas sp.MBR, 应用与环境生物学报, 2012, 第 4 作者
（42） Analysis of water quality factors influencing the speciation of inorganic nitrogen using GRA, JOURNAL OF ENVIRONMENTAL BIOLOGY, 2011, 第 4 作者
（43） 剑南春窖泥理化特性及矿质元素变化趋势研究, Study on the Physiochemical Properties of Pit Mud from Jiannanchuan Pit ＆ the Change Trend of Its Mineral Elements, 酿酒科技, 2011, 第 1 作者
（44） 窖泥细菌群落结构演替及其与环境因子的相关性, Succession of Bacterial Community in Pit Mud and Its Correlations with Environmental Factors, 酿酒科技, 2011, 第 1 作者
（45） 岷江中游成都段河流无机氮形态影响因素初步分析, Preliminary Analysis on Factors Influencing the Speciation of Inorganic Nitrogen in the Chengdu Section of the Middle Reaches of the Min River, 贵州科学, 2011, 第 3 作者
（46） Nitrification and nitrifying bacteria in the Chengdu section of middle Min River (China), AFRICAN JOURNAL OF BIOTECHNOLOGY, 2011, 第 4 作者
（47） 洛阳石化PTA废水生物处理系统污泥膨胀原因解析, ANALYSES ON SLUDGE BULKING OF PTA WASTEWATER BIOTREATMENT SYSTEM IN LUOYANG PETROCI-IEMICAL CORP, 水处理技术, 2011, 第 5 作者
（48） 硝化渗滤液回灌对填埋垃圾反硝化、产甲烷及稳定化的影响, Effect of Nitrified Leachate Recirculation on In-situ Denitrification, Methanogenesis and Stabilization of Landfill, 应用与环境生物学报, 2011, 第 6 作者
（49） Autotrophic nitrogen removal from ammonium at low applied voltage in a single-compartment microbial electrolysis cel., Bioresource Technology, 2011, 
（50） 太湖梅梁湾附生细菌和游离细菌群落结构分析, Comparative Analysis of Community Structure Between Attached and Free-living Bacteria in the Meiliang Bay,Taihu Lake, 应用与环境生物学报, 2011, 第 5 作者
（51） 一株假单胞菌MBR对亚碲酸盐的好氧还原特征, Characterization of Aerobic Reduction of Tellurite by Pseudomonas sp. MBR, 应用与环境生物学报, 2011, 第 4 作者
（52） 一株假单胞菌（PseudomonasalcaliphilaMBR）好氧还原亚硒酸钠为红色单质硒, Reduction of selenite to elemental red selenium under aerobic condition by Pseudomonas alcaliphila MBR, 微生物学报, 2010, 第 4 作者
（53） 高温自养硝化反硝化工艺研究, Autotrophic Nitrification-Denitrification Process at High Temperature, 应用与环境生物学报, 2010, 第 4 作者
（54） 锦江中氨氮污染及生物转化特征分析, The characteristics of pollution and biotransformation of ammonia nitrogen in Jin River, 四川大学学报：自然科学版, 2010, 第 3 作者
（55） 溶微囊藻细菌的富集筛选及其菌群结构特征, Enrichment and Molecular Characterization of a Bacterial Culture Involved in Lysis of Microcystis aeruginosa, 微生物学通报, 2009, 第 3 作者
（56） 不同C/N值下亚硝酸盐氧化菌和异养菌混合体系的微生物多样性（英文）, 应用与环境生物学报, 2009, 第 3 作者
（57） 水华蓝藻暴发的预防与控制技术研究进展, PREVENTION AND CONTROL OF MASS DEVELOPMENT OF CYANOBACTERIA IN AQUATIC SYSTEMS, 水处理技术, 2009, 第 3 作者
（58） Nitrogen removal via ex-situ nitrification and sequential in-situ denitrification from landfill leachate., 2009, 第 1 作者
（59） 自养混合菌群氨氧化特征及结构分析, Ammoxidation characteristics and composition analysis of autotrophic mixed bacteria, 四川大学学报：自然科学版, 2009, 第 8 作者
（60） 硝化菌群强化修复氨氮污染河流水体研究, A preliminary study on enhanced remediation of an ammonia polluted river by nitrifying bacteria, 环境科学学报, 2009, 第 3 作者
（61） Effect of organic carbon on nitrification efficiency and community composition of nitrifying biofilms, JOURNAL OF ENVIRONMENTAL SCIENCES, 2009, 第 4 作者
（62） 垃圾渗滤液原位反硝化研究, In situ Denitrification of Landfill Leachate, 应用与环境生物学报, 2009, 第 4 作者
（63） 溶藻细菌及其分子生物学研究进展, Advances in Research of Algicidal Bacteria, 应用与环境生物学报, 2009, 第 2 作者
（64） Nitrogen removal from landfill leachate via ex situ nitrification and sequential in situ denitrification, WASTE MANAGEMENT, 2009, 第 3 作者
（65） 不同C／N值下亚硝酸盐氧化菌和异养菌混合体系的微生物多样性, Microbial Diversity of Nitrite-oxidizing and Heterotrophic Bacterial Communities under Different C/N Ratios, 应用与环境生物学报, 2009, 第 3 作者
（66） 混合菌群产氢特性研究, Characterization of H2-producing Bacteria in Mixed Cultures, 应用与环境生物学报, 2009, 第 6 作者
（67） Effect of Acetate on Nitrite Oxidation in Mixed-Population Biofilms, JOURNAL OF BIOSCIENCE AND BIOENGINEERING, 2008, 第 3 作者
（68） 稳定混合菌协同降解咔唑研究, Synergetic Degradation of Carbazole by a Stable Microbial Consortium, 应用与环境生物学报, 2008, 第 5 作者
（69） Isolation and description of a stable carbazole-degrading microbial consortium consisting of Chryseobacterium sp NCY and Achromobacter sp. NCW, CURRENT MICROBIOLOGY, 2008, 第 3 作者
（70） Cloning and expression of a chitinase gene from Sanguibacter sp. strain C4., Acta Geneica Sinica., 2006, 第 1 作者
（71） Identification of a chitinase-producing bacterium C4 and histopathologic study on locusts, PEST MANAGEMENT SCIENCE, 2005, 
（72） Purification and characterization of an extracellular chitinase produced by bacterium C4, ANNALS OF MICROBIOLOGY, 2005, 

   

（ 1 ） 窖泥功能微生物鉴定及应用研究, 负责人, 其他国际合作项目, 2011-01--2015-05
（ 2 ） 基于宏基因组与转录组学的窖泥微生物研究, 负责人, 国家任务, 2013-01--2016-12
（ 3 ） 基于宏转录组的窖池微生物共酵生香的分子机理研究, 负责人, 国家任务, 2015-01--2016-12
（ 4 ） 利用发酵工业废水合成己酸的技术研究, 负责人, 中国科学院计划, 2014-06--2015-12
（ 5 ） 稻田土壤镉钝化剂研发与应用, 负责人, 国家任务, 2016-01--2020-12
（ 6 ） 一株新型瘤胃菌产己酸的代谢机理, 负责人, 研究所自主部署, 2017-03--2019-06
（ 7 ） 生物质废水/废弃物转化为中链脂肪酸的关键技术, 负责人, 地方任务, 2016-01--2018-12
（ 8 ） 乳酸利用型己酸功能微生物群体合成库的构建与应用, 负责人, 中国科学院计划, 2016-11--2018-06
（ 9 ） 瘤胃菌CPB6以乳酸为底物合成己酸的分子机制, 负责人, 国家任务, 2018-01--2021-12
（ 10 ） 窖池微生态调控关键技术与应用示范, 负责人, 境内委托项目, 2019-10--2023-12
（ 11 ） 浓香型白酒酿造微生物多样性与风味物质形成相关性 的研究, 负责人, 地方任务, 2021-04--2024-03
（ 12 ） 新型产己酸菌剂的产业化及其在白酒生产中的应用推 广, 参与, 地方任务, 2021-04--2023-12

（1）窖池微生物多样性与资源发掘   第七届全国微生物资源学术暨国际微生物系统与分类学研讨会   2015-08-25
（2）窖池微生物多样性及资源发掘   第十七次（2015）全国微生物学术研讨会   陶勇   2014-11-08
（3）窖泥微生物区系及功能   第十五次全国环境微生物学术研讨会   陶勇   2012-09-26
（4）垃圾渗滤液脱氮处理研究   2010年微生物生态学年会暨国际研讨会    陶勇   2010-08-11
（5）生物控藻研究   第一届河流生态修复学术讨论会   陶勇   2008-10-24