100706-药理学

计算机辅助药物设计，大数据医疗
癌症基因组特征与临床特征关联，药物筛选

2005-09--2010-06   中国农业大学理学院   理学博士
2001-09--2005-06   山东大学数学与系统科学学院   理学学士

   

2022-12~现在, 中国科学院昆明植物研究所, 研究员
2013-12~2014-12,美国维克尔森林医学院, 博士后
2013-10~2022-11,中国科学院西北高原生物研究所, 副研究员
2013-06~2013-12,美国国立卫生院癌症研究中心, 访问学者
2013-01~2013-06,美国堪萨斯大学, 访问学者
2010-07~2013-10,中国科学院西北高原生物研究所, 助理研究员

   

（ 1 ） 一种药物的长非编码RNA靶点预测方法和系统, 发明专利, 2020, 第 1 作者, 专利号: 201610542734.1

   

（1） Design, Synthesis, and Biological Evaluation of Artemyrianolide H Derivatives as Potential Antihepatoma Agents, BIOORGANIC CHEMISTRY, 2023, 第 6 作者
（2） The genetic diversity, replication, and transmission of 2009 pandemic H1N1 viruses in China, FRONTIERS IN MICROBIOLOGY, 2023, 第 2 作者
（3） The molecular characteristics of gastric cancer patients living in Qinghai-Tibetan Plateau, BMC GASTROENTEROLOGY, 2022, 通讯作者
（4） Computational Probing the Methylation Sites Related to EGFR Inhibitor-Responsive Genes, BIOMOLECULES, 2021, 通讯作者
（5） DeepDRK: a deep learning framework for drug repurposing through kernel-based multi-omics integration, BRIEFINGS IN BIOINFORMATICS, 2021, 通讯作者
（6） The Clinical and Molecular Characterization of Gastric Cancer Patients in Qinghai-Tibetan Plateau, FRONTIERS IN ONCOLOGY, 2020, 通讯作者

   

（ 1 ） 药物基因组学数据的整合和深度学习模型与算法研究, 负责人, 国家任务, 2017-01--2020-12
（ 2 ） 基于深度学习网络预测癌细胞对药物敏感度的计算模型和算法研究, 负责人, 地方任务, 2016-01--2018-12
（ 3 ） 基于最优化方法预测长非编码RNA调控基因和其致癌机制的计算模型和算法研究, 负责人, 其他任务, 2020-01--2021-12
（ 4 ） 基于单细胞转录组数据重定位阿尔兹海默症药物, 负责人, 其他任务, 2022-05--2023-08
（ 5 ） 三江源国家公园澜沧江园区植物多样性调查, 负责人, 其他任务, 2022-01--2023-12
（ 6 ） 基于天然产物的抗肝癌与肝纤维化药物研发, 负责人, 中国科学院计划, 2022-12--2027-11

已指导学生

袁锐  硕士研究生  071002-动物学  

刘菲  硕士研究生  071002-动物学  

现指导学生

张竣  硕士研究生  071001-植物学  

陈荣连  硕士研究生  071001-植物学