李轩博士“生物信息学和合成表观生物学”课题组， 围绕生命科学两个方面的重大问题，利用分子生物学实验技术、功能基因组/功能转录组等组学技术、结合生物信息学方法和生物大数据计算， 开展以下方向的研究：

（1）RNA表观生物学：RNA表观遗传机制的系统进化、和RNA表观修饰合成生物学。

（2）天然产物代谢：针对天然产物和药用植物次生代谢产物的功能研究，整合代谢组、表征组 、和功能网络建模方法。

   

071005-微生物学

生物信息学, 合成生物学
基因组学，RNA编辑

1992-07--1996-12   美国圣路易斯大学   生物化学博士
1984-07--1988-07   北京大学   理学士

1992-07--1996-12   美国圣路易斯大学   生物化学博士
1984-07--1988-07   北京大学   理学士

1996   生物化学博士
1988   理学士

动植物的RNA表观生物学
RNA转录组分析与应用
基因组学视角的系统生物学
现代生物学研究方法与技术
生物信息学和系统生物学
微生物比较基因组 和进化基因组
生物信息学和代谢组学
生物信息学引论
生命科学史与新进展
微生物系统和合成生物学
现代生物学理论基础和应用技术
微生物比较基因组和进化基因组
高通量组学技术方法进展与应用
高级生物信息学BI6002

   

（1） 明治乳业生命科学奖, 其他, 2012

（ 1 ） 基于CRISPR-Cas13a干预阻断病毒逆转录转座的技术, 发明专利, 2021, 第 1 作者, 专利号: CN113528515A

（ 2 ） 基于CRISPR-Cas12a干预阻断病毒逆转录转座的技术, 发明专利, 2021, 第 1 作者, 专利号: CN113528514A

（ 3 ） 基于CRISPR-Cas13a的RNA定点编辑技术, 发明专利, 2019, 第 1 作者, 专利号: CN110527697A

（ 4 ） 一种MMR基因突变检测试剂盒, 专利授权, 2017, 第 2 作者, 专利号: CN106367475A

（ 5 ） 豆科植物叶片组织特异性启动子及其应用, 专利授权, 2016, 第 1 作者, 专利号: CN105985958A

（ 6 ） 豆科植物根系组织特异性启动子及其应用, 发明专利, 2015, 第 1 作者, 专利号: CN104673793A

（ 7 ） 豆科植物豆荚相关组织特异性启动子及其应用, 发明专利, 2015, 第 1 作者, 专利号: CN104673792A

（ 8 ） 一种利用测序技术检测未知病毒的方法, 发明专利, 2013, 第 1 作者, 专利号: CN102952895A

（ 9 ） 一种利用DNA序列条码矫正二代高通量测序的序列丰度偏差的方法, 发明专利, 2010, 第 1 作者, 专利号: CN101845500A

   

（ 1 ） 基因反式剪接起源和进化的大数据研究及其在基因演化中的功能, 负责人, 国家任务, 2016-01--2019-12
（ 2 ） 分子模块系统解析与耦合组装, 参与, 中国科学院计划, 2013-08--2018-08
（ 3 ） 作物特殊营养品质的评价、形成机理与分子改良, 参与, 国家任务, 2013-01--2017-12
（ 4 ） 天然产物小分子细胞表达图谱信息数据库及分子功能算法研究, 负责人, 国家任务, 2013-01--2016-12
（ 5 ） 多种新一代测序技术的数据产生模型与优化处理方法, 负责人, 国家任务, 2012-01--2016-12
（ 6 ） 基因表达调控技术研究, 参与, 国家任务, 2016-07--2020-12
（ 7 ） 基于组学大数据解析RNA编辑带来的基因进化动力学改变和功能适应性, 负责人, 国家任务, 2018-01--2021-12
（ 8 ） 酶库建设, 负责人, 中国科学院计划, 2016-11--2020-12
（ 9 ） 基于化学生物学与质谱前沿技术的应急药物分子靶标筛选体系建设及相关技术服务, 参与, 国家任务, 2018-01--2021-12
（ 10 ） 深渊生物天然产物的系统发现及应用潜力评价, 负责人, 国家任务, 2018-08--2021-12
（ 11 ） 水稻功能性次生代谢的分子网络, 负责人, 中国科学院计划, 2019-11--2024-10
（ 12 ） 工业反应酶库实体库及数字化建设, 负责人, 中国科学院计划, 2021-11--2024-10
（ 13 ） 组学大数据解析植物长非编码RNA的系统进化和种群特异性功能, 负责人, 国家任务, 2020-01--2023-12
（ 14 ） 原核生物基因组的人工模块化与简约化, 参与, 国家任务, 2019-07--2024-06
（ 15 ） 光合微生物中流平衡分析及CRISPR-Cas9 技术的开发, 参与, 国家任务, 2020-01--2024-12
（ 16 ） 深度代谢组方法解析陆生植物代谢组大数据及其复杂代谢网络, 负责人, 国家任务, 2023-01--2026-12

（1）核酸药物治疗的靶向设计与挑战   2022上海智能医学论坛暨第五届复旦大学人工智能医学影像论坛   2022-12-04
（2）深度代谢组学方法与天然产物发现   上海生物信息学会2021年学术年会   2021-12-22
（3）Deep metabolomics methods and identification of natural products and functions   2021-12-03

已指导学生

潘伯虎  博士研究生  071005-微生物学  

孔艺萌  博士研究生  071005-微生物学  

周红霞  博士研究生  071005-微生物学  

陈萍  博士研究生  071005-微生物学  

解冰冉  博士研究生  071005-微生物学  

陈龙现  博士研究生  071005-微生物学  

李雪童  博士研究生  071005-微生物学  

李佳  硕士研究生  071005-微生物学  

秦航  博士研究生  071005-微生物学  

江涛  硕士研究生  085238-生物工程  

现指导学生

张梦杰  博士研究生  071005-微生物学  

周辉  博士研究生  071005-微生物学  

龚洁  硕士研究生  071005-微生物学  

张牛冰  博士研究生  071005-微生物学  

周小娟  博士研究生  071005-微生物学  

程香  硕士研究生  071005-微生物学  

时晗  博士研究生  071005-微生物学  

郝陈惠  硕士研究生  071005-微生物学