基本信息
John Seymour Heslop Harrison  男  博导  中国科学院华南植物园
电子邮件: phh4@le.ac.uk
通信地址: 中国科学院华南植物园五号实验楼106
邮政编码: LE1 7RH

研究领域

1. 多倍体作物基因组互作与机制研究。研究对象芸苔属(Brassica) 二倍体和四倍体作物物种,采用染色质免疫共沉淀(ChIP)、生物信息学与显微镜技术,探讨多倍体中基因控制如何发生的,及如何控制表达和染色质修饰。

2. 系统发育和多样性研究。研究对象选择芭蕉目芭蕉属(Musa)、姜目凹唇姜属(Boesenbergia)、象腿蕉属(Ensete)、姜属(Zingiber)Stelitzia属,探讨染色体、基因组演化和植物多样性问题。

3. 基因组分析工具开发。关注两个层次问题:在转座子和卫星DNA水平的重复序列差异,挖掘物种水平基因组结构和序列变化;开发新的分析工具,拟解决二歧分支假说为基础的计算机程序缺陷,为多倍体物种谱系关系和杂种基因组起源提供证据。


招生信息

   
招生专业
071007-遗传学
071001-植物学
招生方向
植物遗传育种学, 植物分子遗传学

教育背景

1980-10--1983-02   英国剑桥大学   博士
1977-09--1980-06   英国威尔士大学   硕士

工作经历

工作简历
2018-11~2023-10,中国科学院华南植物园, 教授
2000-11~现在, 英国莱斯特大学, 教授
1990-06~2000-09,英国John Innes Center, 首席科学家
1986-10~1990-05,英国农业研究理事会植物学科学研究所, 科学家
社会兼职
2012-01-01-今,Chromosome Research, 荣誉主编
2009-01-01-2011-12-31,生物细胞遗传学会, 主席
2007-12-31-今,Annals of Botany主编, 主编
2005-01-01-今,全球芭蕉基因组联盟, 管理委员会成员
2003-12-31-今,欧洲细胞遗传学会, 副主席
2000-01-01-今,联合国粮食与农业组织IAEA/FAO, 常任专家顾问

出版信息

Full list of 379 publications please browser https://www.le.ac.uk/biology/phh4/titles.html

  • 379. Wang Z, Rouard M, Biswas MK, Droc G, Cui D, Roux N, Baurens FC, Ge XJ, Schwarzacher T, Heslop-Harrison JS, Liu Q 2022. A chromosome-level reference genome of Ensete glaucum gives insight into diversity, chromosomal and repetitive sequence evolution in the Musaceae. Gigascience March 2022. and bioRxiv. 2021 https://doi.org/10.1101/2021.11.23.4694741.
  • 378. Ran Li, Mian Gong, Xinmiao Zhang, Fei Wang, Zhenyu Liu, Lei Zhang, Mengsi Xu, Yunfeng Zhang, Xuelei Dai, Zhuangbiao Zhang, Wenwen Fang, Yuta Yang, Huanhuan Zhang, Weiwei Fu, Chunna Cao, Peng Yang, Zeinab Amiri Ghanatsaman, Niloufar Jafarpour Negari, Hojjat Asadollahpour Nanaei, Xiangpeng Yue, Yuxuan Song, Xianyong Lan, Weidong Deng, Xihong Wang, Ruidong Xiang, Eveline M. Ibeagha-Awemu, Pat (J.S.) Heslop-Harrison, Johannes A. Lenstra, Shangquan Gan, Yu Jiang. 2021. The first sheep graph-based pan-genome reveals the spectrum of structural variations and their effects on tail phenotypes. bioRxiv 2021.12.22.472709; doi: https://doi.org/10.1101/2021.12.22.472709
  • 377. Zhou S, Richert-Pöggeler KR, Wang Z, Schwarzacher T, Heslop-Harrison JS, Liu Q. 2022. High throughput RNA sequencing discovers symptomatic and latent viruses: an example from ornamental Hibiscus.  bioRxiv 2022.01.25.477650; doi: https://doi.org/10.1101/2022.01.25.477650
  • 376. Liu Q, Yuan HY, Li MZ, Wang ZW, Cui DL, Ye Y, Sun Z, Tan X, Schwarzacher T, Heslop-Harrison JS. 2022. Chromosome-scale genome assembly of the diploid oat Avena longiglumis reveals the landscape of repetitive sequences, genes and chromosome evolution in grasses  bioRxiv 2022.02.09.479819; doi: https://doi.org/10.1101/2022.02.09.479819
  • 375. Mustafa SI, Schwarzacher T, Heslop-Harrison JS. 2022. The nature and chromosomal landscape of endogenous retroviruses (ERVs) integrated in the sheep nuclear genome. DNA (subject to revision) bioRxiv 2022.02.11.480048; doi: https://doi.org/10.1101/2022.02.11.480048
  • 374. Tomaszewska P, Vorontsova MS, Renvoize SA, Ficinski SZ, Tohme J, Schwarzacher T, Castiblanco V, de Vega JJ, Mitchell RA, Heslop-Harrison P. 2022. Complex polyploid and hybrid species in an apomictic and sexual tropical forage grass group: genomic composition and evolution in Urochloa (Brachiaria). Annals of Botany, mcab147 . doi:10.1093/aob/mcab147
  • 373. Higgins J, Tomaszewska P, Pellny TK, Castiblanco V, Arango J, Tohme J, Schwarzacher T, Mitchell RA, Heslop-Harrison JS, De Vega JJ. 2021. The five Urochloa spp. used in development of tropical forage cultivars originate from defined subpopulations with differentiated gene pools. BioRXiv 2021.07.21.453213. doi:10.1101/2021.07.21.453213
  • 372. Hanley SJ, Pellny TK, de Vega JJ, Castiblanco V, Arango J, Eastmond PJ, Heslop-Harrison JSP, Mitchell RAC. 2021. Allele mining in diverse accessions of tropical grasses to improve forage quality and reduce environmental impact. Annals of Botany Sep 7;128(5):627-637. doi:10.1093/aob/mcab101
  • 371. Richert-Pöggeler KR, Vijverberg K, Alisawi O, Chofong GN, Heslop-Harrison JSP, Schwarzacher T. 2021. Participation of multifunctional RNA in replication, recombination and regulation of Endogenous Plant PararetroViruses (EPRVs). Frontiers in Plant Science Jun 21;12:689307. doi:10.3389/fpls.2021.689307
  • 370. Barile FA, Berry SC, Blaauboer B, Boobis A, Bolt HM, Borgert C, Dekant W, Dietrich D, Domingo JL, Galli CL, Gori GB, Hengstler JG, Heslop-Harrison P, Kacew S, Marquardt H, Mally A, Pelkonen O, Savolainen K, Testai E, Tsatsakis A, Vermeulen NP. 2021. The EU chemicals strategy for sustainability: in support of the BfR position. Archives of Toxicology Sep;95(9):3133-6. doi:10.1007/s00204-021-03125-w


发表论文
(1) A chromosome-level reference genome of Ensete glaucum gives insight into diversity and chromosomal and repetitive sequence evolution in the Musaceae, GigaScience, 2022, 
(2) Allele mining in diverse accessions of tropical grasses to improve forage quality and reduce environmental impact, Annals of Botany, 2021, 第 1 作者
(3) Ten complete mitochondrial genomes of Gymnocharacini (Stethaprioninae, Characiformes): evolutionary relationships and a repetitive element in the Control Region (D-loop), Frontiers in Ecology and Evolution, 2021, 
(4) Flow Cytometry-Based Determination of Ploidy from Dried Leaf Specimens in Genomically Complex Collections of the Tropical Forage Grass Urochloa s. l., Genes, 2021, 
(5) Panicum virgatum (Poaceae), TRENDS IN GENETICS, 2021, 
(6) Participation of Multifunctional RNA in Replication, Recombination and Regulation of Endogenous Plant Pararetroviruses (EPRVs), FRONTIERS IN PLANT SCIENCE, 2021, 
(7) Anchoring alien chromosome segment substitutions bearing gene(s) for resistance to mustard aphid in Brassica juncea-B. fruticulosa introgression lines and their possible disruption through gamma irradiation, THEORETICAL AND APPLIED GENETICS, 2021, 
(8) 人类对合成内分泌干扰化学品(S-EDCs), Computational Toxicology, 2020, 第 1 作者
(9) 埃塞俄比亚孤儿作物不同地方品种的微量元素组成和微生物群落分析, Food Research International, 2020, 第 1 作者
(10) 燕麦属重复序列结构特征, BMC Plant Biology, 2019, 通讯作者
(11) 牛科卫星DNA进化历史及其对Bovidae家族的影响, European Zoological Journal, 2019, 第 1 作者
(12) 牛科着丝粒卫星DNA家族的分化及功能, Genome Biology and Evolution, 2019, 第 1 作者
(13) 蛋白质和DNA序列的同时可视化提供胞核减数分裂证据, Frontiers in Plant Science, 2018, 第 1 作者
(14) 多年生黑麦草遗传图谱, Frontiers in Plant Science, 2018, 第 1 作者
(15) 埃塞俄比亚亚麻籽生物多样性, Genetic Resources and Crop Evolution, 2018, 第 1 作者
(16) Kurdistani羊全线粒体基因组序列, Mitochondrial DNA Part A, 2018, 第 1 作者
(17) 蛋白质和DNA序列模拟可视化提供胞核减数分裂证据, Frontiers in Plant Science, 2018, 第 1 作者
(18) 六倍体小麦花粉减数分裂过程CENH3蛋白与着丝粒形态建成动力学过程, Plant Journal, 2017, 第 1 作者
(19) 芭蕉属基因组反转录转座子结构多样性, Molecular Genetics and Genomics, 2017, 通讯作者
(20) 多倍体种间杂交模式及多样性, Annals of Botany, 2017, 第 1 作者
(21) 鲶鱼基因组重复序列研究, Journal of Heredity, 2017, 第 1 作者
(22) 芸薹属基因组重复序列LINE元件结构特征研究, Gene, 2017, 第 1 作者
(23) 欧盟安全条例-勿使伪科学合法化, Nature, 2016, 第 1 作者
(24) 织物比较基因组结构-从序列到遗传标记, Plant Cell, 2000, 第 1 作者
发表著作
(1) 原位杂交实验, Practical in situ Hybridization, BIOS Scientific Publishers, 2000-07, 第 2 作者

科研活动

   
科研项目
( 1 ) 华南植物园海外知名学者项目, 主持, 市地级, 2018-05--2023-08
参与会议
(1)Biodiversity and Superdomestication   生物多样性日国际会议   2021-05-22
(2)Consequences of repetitive DNA organization and evolution in diploid and polyploid crops   第七届亚太染色体国际会议   Pat Heslop Harrison   2020-11-25
(3)Chromosome and Genome Evolution in Plants and Animals   布拉格染色体研究国际会议   2018-09-01
(4)Molecular cytogenetics and genomics of Brassica   俄罗斯细胞遗传学家协会会议   2018-08-01
(5)Building partnerships for development, several locations   与哥伦比亚伙伴关系简历与发展   2018-06-13
(6)香港浸会大学基金项目评审员   香港浸会大学基金项目评审   2018-04-25
(7)Mendel Seminar   孟德尔研讨会   2018-04-10

指导学生

现指导学生

周书玉  硕士研究生  071007-遗传学  

王梓维  博士研究生  071007-遗传学  

崔冬丽  博士研究生  071007-遗传学  

袁泓宇  硕士研究生  086000-生物与医药  

博士生

王梓维

崔冬丽

硕士生
周书玉