海洋生物基因组学
海洋药物
水产养殖与分子育种
分子与比较内分泌学

   

071022-基因组学
090801-水产养殖
070703-海洋生物学

基因组学-海洋生物基因组学研究
鱼类分子育种
海洋药物

1997-08--1999-10   北京师范大学   博士后、副教授
1991-09--1997-06   中山大学   硕士、博士
1987-09--1991-06   湖北大学   学士

博士

博士

2011-05-至今： 深圳华大基因研究院研究员
2008-01--2011-04 美国OriGene Technologies Inc 科学家
2007-06--2008-01 美国马里兰大学 科研职员
2002-04--2007-04 美国国立卫生研究院（NIH） 访问研究员
1999-11--2001-12 日本北海道大学 日本学术振兴会特别研究员

2016-04~现在, 深圳市华大海洋研究院, 院长
2016-04~现在, 中国水产科学研究院华大水产基因组研究中心, 首席科学家
2015-01~现在, 广东省海洋经济动物分子育种重点实验室, 主任
2014-12~现在, 镇江华大水生生物研究所, 副所长
2012-09~现在, 深圳华大水产科技有限公司, 副总经理兼首席科学家
2011-10~现在, 深圳市海洋生物基因组学重点实验室, 主任
2011-05~现在, 深圳华大基因研究院, 研究员、海洋平台负责人
2008-01~2011-04,美国OriGene Technologies Inc, 科学家
2007-06~2008-01,美国马里兰大学, 科研职员
2002-04~2007-04,美国国立卫生研究院（NIH）, 访问研究员
1999-11~2001-12,日本北海道大学, 日本学术振兴会特别研究员

2017-01-11-今,大连海洋大学客座教授, 客座教授
2016-10-15-今,中山大学特聘研究员,
2015-10-28-今,深圳大学客座教授,
2015-01-01-2016-12-31,广东省海洋经济动物分子育种重点实验室, 主任
2014-10-01-今,东南大学兼职课程教授,
2012-10-01-今,广东海洋协会常务理事,
2012-06-01-今,广东省科技评审专家,
2012-04-30-今,深圳市海洋生物基因组学重点实验室学术委员会, 副主任
2012-01-01-今,国家海洋863项目咨询专家组成员,
2012-01-01-今,深圳市科技评审专家,
2011-07-01-今,肇庆学院客座教授,

海洋生物基因组学概论

已获得国家专利7项，申请8项。

（1） 深圳市产业发展与创新人才奖, 市地级, 2015
（2） 镇江市创新创业领军人才, 市地级, 2015
（3） 湖北省学术著作出版基金, , 省级, 2014

（ 1 ） 一种旋流集污式蛋白质分离器, 实用新型, 2013, 第 3 作者, 专利号: ZL201320070383.0
（ 2 ） 一种养殖水循环净化装置, 实用新型, 2013, 第 4 作者, 专利号: ZL201320070521.5
（ 3 ） 一种多功能生态处理器, 实用新型, 2013, 第 5 作者, 专利号: ZL201320070442.4
（ 4 ） 一种复合型生物机械过滤器, 实用新型, 2013, 第 4 作者, 专利号: ZL201320071189.4
（ 5 ） 固液分离装置, 实用新型, 2013, 第 4 作者, 专利号: ZL201320233040.1
（ 6 ） 鱼类饲养系统, 实用新型, 2013, 第 2 作者, 专利号: ZL201320422565.X
（ 7 ） SNP标记及其应用, 发明, 2016, 第 2 作者, 专利号: ZL201310411234.0
（ 8 ） SNP标记及其应用, 发明, 2016, 第 2 作者, 专利号: ZL201310411231.7
（ 9 ） 滩涂环境模拟装置, 实用新型, 2014, 第 2 作者, 专利号: ZL201320513369.3
（ 10 ） 芋螺毒液管cDNA文库及其构建方法和用途, 发明, 2013, 第 2 作者, 专利号: 201310497170.0
（ 11 ） 一种鲟鱼活鱼运输箱, 实用新型, 2015, 第 2 作者, 专利号: 201520103282.8
（ 12 ） 一种大型鲟鱼运输方法, 实用新型, 2015, 第 2 作者, 专利号: 201510075563.1
（ 13 ） 一种鲟鱼性别差异性分子标记及其应用, 发明, 2015, 第 1 作者, 专利号: 201510075500.6
（ 14 ） 一种鲟鱼苗培育方法及其培育池, 实用新型, 2015, 第 3 作者, 专利号: 201510075498.2
（ 15 ） 鱼类立体养殖系统, 实用新型, 2015, 第 3 作者, 专利号: Zl201420623248.9
（ 16 ） 一种适用于大弹涂鱼活体运输的方法, 发明, 2015, 第 2 作者, 专利号: 201510469570.X
（ 17 ） 一种华鲮DNA条形码标准检测基因及其应用, 发明, 2015, 第 3 作者, 专利号: 201510970709.9
（ 18 ） 一种拟高原鳅DNA条形码标准检测基因及其应用, 发明, 2015, 第 3 作者, 专利号: 201510976011.8
（ 19 ） 一种养殖水体净化方法及装置, 发明, 2014, 第 4 作者, 专利号: ZL201310049019.0
（ 20 ） 旋流集污式蛋白质分离器, 发明, 2014, 第 3 作者, 专利号: ZL201310048556.3
（ 21 ） 多功能生态处理器, 发明, 2014, 第 5 作者, 专利号: ZL201310048496.5

1. 石 琼（参编）。现代神经科学研究方法。吴俊芳、刘忞主编。北京：中国协和医科大学出版社。2006年，总1048页。          
2. 叶百宽、石 琼（主编）。松果体与健康。北京：人民军医出版社出版社。2008年，总268页。
3. 石 琼（主编）。中国具足丝贝类图鉴。深圳：深圳报业集团出版社。2012年，总155页。
4. 石 琼、范明君、张勇（主编）。中国经济鱼类志。武汉：华中科技大学出版社。2014年，总443页。
5. 石 琼、孙颖（主译）。海洋生物基因组学概论。广州：中山大学出版社。2015年，总411页。
6. 宋林生、石 琼（主编）。海洋生物功能基因开发与利用。上海：科学出版社。2015年，正在印刷。
7. 石 琼（参编）。海洋生物资源开发利用高技术丛书，焦柄华总主编。上海：科学出版社。2015年，正在印刷。

（1） China is initiating the Aquatic 10-100-1,000 Genomics Program, Science China Life Sciences, 2017, 通讯作者
（2） 中国正式启动水产生物十百千组学育种计划, 中国科学：生命科学, 2017, 通讯作者
（3） Molecular evolution of aralkylamine N-acetyltransferaase in fish: a genomic survey, International Journal of Molecular Sciences, 2016, 通讯作者
（4） The Sinocyclocheilus cavefish genome provides insights into cave adaptation, BMC Biology, 2016, 通讯作者
（5） Draft genome of the Chinese mitten crab, Eriocheir sinensis, GigaScience, 2016, 通讯作者
（6） The complete mitochondrial genome of horn-nosed boxfish (Ostracion rhinorhynchos), Mitochondrial DNA Part B, 2016, 通讯作者
（7） The complete mitochondrial genome of Florida gar (Lepisosteus platyrhincus), Mitochondrial DNA Part B, 2016, 通讯作者
（8） Complete mitochondrial genome of stripped eel catfish (Plotosus lineatus), Mitochondrial DNA Part B, 2016, 通讯作者
（9） The complete mitochondrial genome of Eastern paradise fish (Polynemus dubius), Mitochondrial DNA Part B, 2016, 通讯作者
（10） Genome-wide mapping of growth-related quantitative trait loci in orange-spotted grouper (Epinephelus coioides) using double digest restriction-site associated DNA sequencing (ddRADseq), International Journal of Molecular Sciences, 2016, 通讯作者
（11） Prediction of toxin genes from Chinese yellow catfish based on transcriptomic and proteomic sequencing, International Journal of Molecular Sciences, 2016, 通讯作者
（12） High-throughput identification of novel conotoxins from Conus betulinus by multi-transcriptome sequencing, GigaScience, 2016, 通讯作者
（13） The Asian arowana (Scleropages formosus) genome provides new insights into the evolution of an early lineage of teleosts, Scientific Reports, 2016, 通讯作者
（14） Fish-T1K (Transcriptomes of 1,000 Fishes) project: large-scale transcriptome data for fish evolution studies, GigaScience, 2016, 通讯作者
（15） Marine genomics: recent advancement and wide-area applications, Marine Omics: Principles and Applications, 2016, 通讯作者
（16） Complete genome sequence of a marine bacterium, Pseudomonas pseudoalcaligenes strain S1, with high mercury resistance and bioaccumulation capacities., Genome Announcements, 2016, 通讯作者
（17） The complete mitochondrial genome of Indonesian snakehead, Channa micropeltes (Channiformes, Channidae), Mitochondrial DNA Part B, 2016, 通讯作者
（18） A genomics study on the arm-like pectrol fins in amphibious mudskippers., Annals of Marine Biology and Research, 2016, 通讯作者
（19） Research advances on molecular breeding of groupers in China, Austin Journal of Molecular and Cellular Biology, 2016, 通讯作者
（20） High-quality genome assembly of channel catfish, Ictalurus punctatus., GigaScience, 2016, 通讯作者
（21） The complete mitochondrial genome of the giant mudskipper, Periophthalmodon schlosseri (Perciformes, Gobiidae), Mitochondrial DNA Part B, 2016, 通讯作者
（22） The complete mitochondrial genome of the yellow-spotted triggerfish (Pseudobalistes fuscus)., Mitochondrial DNA Part B, 2016, 通讯作者
（23） Research advances of fish genomics in China, Insights in Genetics and Genomics, 2016, 通讯作者
（24） A chromosome-level genome assembly of the Asian arowana, Scleropages formosus., Scientific Data, 2016, 通讯作者
（25） The seahorse genome and the evolution of its specialized morphology, Nature, 2016, 通讯作者
（26） A genomic survey on the immune differences among Sinocyclocheilus fishes., Communicative & Integrative Biology, 2016, 通讯作者
（27） Comparative transcriptomic study of muscle provides new insights into the growth superiority of a grouper hybrid, PLOS One, 2016, 通讯作者
（28） 中国南方红树林湿地弹涂鱼遗传多样性研究, 南方农业, 2015, 通讯作者
（29） Construction of the high-density genetic linkage map and chromosome map of large yellow croaker (Larimichthys crocea), International Journal of Molecular Sciences, 2015, 通讯作者
（30） Construction of the high-density genetic linkage map and chromosome map of large yellow croaker (Larimichthys crocea), International Journal of Molecular Sciences, 2015, 通讯作者
（31） 弹涂鱼两栖习性的基因组学研究进展, 海洋渔业, 2015, 通讯作者
（32） The complete mitochondrial genome of horned golden-line barbel, Sinocyclocheilus rhinocerous (Cypriniformes, Cyprinidae), Mitochondrial DNA, 2015, 通讯作者
（33） The complete mitochondrial genome of a cavefish Sinocyclocheilus anshuiensis (Cyprininformes: Cyprinidae), Mitochondrial DNA, 2015, 通讯作者
（34） Trehalose metabolism in the blue crab Callinectes sapidus: Isolation of multiple structural cDNA isoforms of trehalose-6-phosphate synthase and their expression in muscles, Gene, 2014, 第 1 作者
（35） Cloning and expression of melatonin receptor in the mudskipper Boleophthalmus pectinirostris: Their role in synchronization of semilunar spawning rhythm, General and Comparative Endocrinology, 2014, 第 4 作者
（36） Mudskipper genomes provide insights into terrestrial adaptation of amphibious fishes, Nature Communications, 2014, 通讯作者
（37） 大弹涂鱼aanat2基因cDNA克隆及, 厦门大学学报, 2013, 通讯作者
（38） Construction of high-density genetic linkage maps for orange-spotted grouper Epinephelus , BMC Genetics, 2013, 通讯作者

（ 1 ） 中国具足丝贝类图鉴, Collection of mussels with byssus in China, 深圳报业集团出版社, 2012-06, 第 1 作者
（ 2 ） 中国经济鱼类志, Commercially important fish in China, 华中科技大学出版社, 2013-10, 第 1 作者
（ 3 ） 海洋生物基因组学概论, Introduction to Marine Genomics, 中山大学出版社, 2015-08, 第 1 作者
（ 4 ） 基因组学及其应用专业英语, 中山大学出版社, 2015-09, 第 3 作者
（ 5 ） 海洋生物功能基因开发与利用, 科学出版社, 2016-08, 第 2 作者

   

（ 1 ） 新型放射性废水净化用海洋生物材料的人工仿制研发, 主持, 国家级, 2013-01--2016-12
（ 2 ） 石斑鱼优质新品种的工厂化养殖示范与推广, 主持, 省级, 2012-10--2014-06
（ 3 ） 石斑鱼优质新品种的工业循环水养殖示范, 主持, 国家级, 2013-01--2015-12
（ 4 ） 半滑舌鳎的南方工厂化养殖示范与推广, 主持, 省级, 2013-01--2015-12
（ 5 ） DNA条形码系统支撑的海洋水产食品安全体系建设, 参与, 省级, 2014-08--2017-08
（ 6 ） 广东省海洋经济动物分子育种重点实验室, 主持, 省级, 2015-01--2016-12
（ 7 ） 海洋鱼类分子育种关键共性技术研发, 主持, 省级, 2015-01--2016-12
（ 8 ） 长江土著鲶种质鉴定与繁育技术研究, 主持, 省级, 2015-01--2016-12
（ 9 ） 海洋生物功能蛋白高效发掘与产品开发（子课题）, 参与, 国家级, 2014-01--2016-12
（ 10 ） 石斑鱼优质新品种的工业循环水养殖示范（配套经费）, 主持, 省级, 2015-10--2016-06
（ 11 ） 长江流域经济鱼类的基因组学研究及育种应用, 主持, 省级, 2015-01--2017-12
（ 12 ） 重要南方海水养殖鱼类分子育种（配套经费）, 主持, 省级, 2015-01--2016-12
（ 13 ） 转录组测序技术支撑的新型芋螺毒素研发, 主持, 省级, 2016-01--2017-12
（ 14 ） 基于全基因组测序的青虾种质资源和功能基因挖掘, 主持, 省级, 2015-01--2017-12
（ 15 ） 鳜鱼生长性状分子标记挖掘, 主持, 省级, 2016-01--2018-12
（ 16 ） 深圳市2016年国家和省配套项目：广东省海洋经济动物分子育种重点实验室, 主持, 省级, 2016-01--2017-12
（ 17 ） 基因组学和生物信息学支撑的新型海洋药物研发, 主持, 省级, 2016-01--2017-12

（1）Fish Genomics at BGI   Qiong Shi   2015-07-12

已指导学生

刘光  02  63228  

李佳  02  63228  

现指导学生

于辉  02  63228  

易云海  02  67917  

冯少鸿  01  67917  

董博  01  67917  

张凯  01  67917  

张一平  02  63228  

廖水林  02  67917  

赵晓萌  02  67917  

刘雨露   02  67917  

张鹏帆  02  67917  

吕云云  01  67917  

陈微微  01  67917