植物分子系统学，植物DNA条形码，被子植物系统发育基因组学

   

071001-植物学
086000-生物与医药

植物多样性与基因组学
植物多样性演化与分子进化
植物种质资源保育与利用

2004-09--2007-06   中国科学院昆明植物研究所   博士
2001-09--2004-07   云南农业大学   硕士
1990-09--1993-06   怀化学院   学生

   

2021-01~现在, 中国科学院昆明植物研究所, 研究员
2016-01~2020-12,中国科学院昆明植物研究所, 项目研究员
2011-01~2015-12,中国科学院昆明植物研究所, 高级工程师
2007-07~2010-12,中国科学院昆明植物研究所, 助理研究员
1993-07~2001-08,湖南省冷水江市毛易中学, 教师

   

（1） 被子植物及其关键类群的分子系统发育和演化, 一等奖, 省级, 2023
（2） 中国植物DNA条形码研究, 二等奖, 省级, 2017

（ 1 ） 一种基于二叉树的植物数据存储、鉴定方法及系统, 发明专利, 2020, 专利号: CN111984646A

（ 2 ） 一种基于二代测序的植物叶绿体全基因组组装成环方法, 发明专利, 2019, 专利号: CN109411014A

（ 3 ） 一种使用叶绿体DNA条形码对罂粟的鉴定方法, 发明专利, 2018, 专利号: CN108396070A

（ 4 ） 高度降解样本中植物性DNA的检测引物, 专利授权, 2018, 专利号: CN108018339A

（ 5 ） 分子生物学整合实验台, 实用新型, 2013, 专利号: CN203303986U

   

（1） DNA barcoding of Cymbidium by genome skimming: Call for next-generation nuclear barcodes, MOLECULAR ECOLOGY RESOURCES, 2023, 通讯作者
（2） Phylotranscriptomic analyses reveal multiple whole-genome duplication events, the history of diversification and adaptations in the Araceae, ANNALS OF BOTANY, 2023, 第 6 作者
（3） Phylogenomics and the flowering plant tree of life, JOURNAL OF INTEGRATIVE PLANT BIOLOGY, 2023, 第 5 作者
（4） Correlation Analysis Reveals an Important Role of GC Content in Accumulation of Deletion Mutations in the Coding Region of Angiosperm Plastomes, JOURNAL OF MOLECULAR EVOLUTION, 2021, 第 2 作者
（5） Comparative plastomic analysis and insights into the phylogeny of Salvia (Lamiaceae), Comparative plastomic analysis and insights into the phylogeny of Salvia (Lamiaceae), PLANT DIVERSITY, 2021, 第 3 作者
（6） Plastid phylogenomic insights into relationships of all flowering plant families, BMC BIOLOGY, 2021, 第 1 作者
（7） The patterns of vascular plant discoveries in China, ECOLOGY AND EVOLUTION, 2021, 第 3 作者
（8） Origin of angiosperms and the puzzle of the Jurassic gap, NATURE PLANTS, 2019, 第 1 作者
（9） Plastid phylogenomic insights into the evolution of caryophyllales, MOLECULAR PHYLOGENETICS AND EVOLUTION, 2019, 第 3 作者
（10） Comparative analysis of the complete chloroplast genomes of four aconitum medicinal species, MOLECULES, 2018, 第 3 作者
（11） Diversification of Rosaceae since the Late Cretaceous based on plastid phylogenomics, NEW PHYTOLOGIST, 2017, 第 6 作者
（12） Comparative analyses of plastid genomes from fourteen Cornales species: inferences for phylogenetic relationships and genome evolution, BMC GENOMICS, 2017, 第 2 作者
（13） Plastid Phylogenomic Analyses Resolve Tofieldiaceae as the Root of the Early Diverging Monocot Order Alismatales, GENOME BIOLOGY AND EVOLUTION, 2016, 第 3 作者
（14） Using in silico techniques: Isolation and characterization of an insect cuticle-degrading-protease gene from Beauveria bassiana, MICROBIAL PATHOGENESIS, 2016, 
（15） Fifteen novel universal primer pairs for sequencing whole chloroplast genomes and a primer pair for nuclear ribosomal DNAs, JOURNAL OF SYSTEMATICS AND EVOLUTION, 2016, 通讯作者
（16） Complete Plastid Genome Sequencing of Four Tilia Species (Malvaceae): A Comparative Analysis and Phylogenetic Implications, PLOS ONE, 2015, 第 3 作者
（17） Highly effective sequencing whole chloroplast genomes of angiosperms by nine novel universal primer pairs, MOLECULARECOLOGYRESOURCES, 2014, 通讯作者
（18） Developmental Genetics of the Perianthless Flowers and Bracts of a Paleoherb Species, Saururus chinensis, PLOS ONE, 2013, 第 7 作者
（19） Comparative Chloroplast Genomes of Camellia Species, PLOS ONE, 2013, 通讯作者
（20） Complete chloroplast genome of the genus Cymbidium: lights into the species identification, phylogenetic implications and population genetic analyses, BMC EVOLUTIONARY BIOLOGY, 2013, 通讯作者
（21） Genetic Information and Technologies Related to iFlora, Plant Diversity and Resourcues, 2012, 第 1 作者
（22） Phylogeny and Evolution of Bracts and Bracteoles in Tacca (Dioscoreaceae), JOURNAL OF INTEGRATIVE PLANT BIOLOGY, 2011, 第 2 作者
（23） ISOLATION AND CHARACTERIZATION OF 15 MICROSATELLITE MARKERS FROM THE SPRING ORCHID (CYMBIDIUM GOERINGII) (ORCHIDACEAE), AMERICAN JOURNAL OF BOTANY, 2011, 第 3 作者
（24） Comparative analysis of a large dataset indicates that internal transcribed spacer (ITS) should be incorporated into the core barcode for seed plants, PNAS ( PROC NATL ACAD SCI U S A), 2011, 第 3 作者
（25） Genetic diversity of the traditional Chinese medicinal plant Ypsilandra thibetica (Melanthiaceae): Applications for conservation, BIOCHEMICAL SYSTEMATICS AND ECOLOGY, 2011, 第 1 作者
（26） A molecular phylogenetic study of Hemsleya (Cucurbitaceae) based on ITS, rpl16, trnH-psbA, and trnL DNA sequences, PLANT SYSTEMATICS AND EVOLUTION, 2010, 第 1 作者
（27） Pollen morphology of Gaultheria L. and related genera of subfamily Vaccinioideae: Taxonomic and evolutionary significance, REVIEW OF PALAEOBOTANY AND PALYNOLOGY, 2009, 第 4 作者
（28） Isolation and Characterization of Microsatellite Markers in the Endangered Species Taxus wallichiana Using the FIASCO Method, HORTSCIENCE, 2009, 第 2 作者
（29） Isolation and characterization of 15 microsatellite markers from wild tea plant (Camellia taliensis) using FIASCO method, CONSERVATION GENETICS, 2009, 第 3 作者
（30） Genetic diversity within and among populations of the endangered species Taxus fuana (Taxaceae) from Pakistan and implications for its conservation, BIOCHEMICAL SYSTEMATICS AND ECOLOGY, 2008, 第 4 作者
（31） Systematic position of Gomphogyne (Cucurbitaceae) inferred from ITS, rpl16 and trnS-trnR DNA sequences, JOURNAL OF SYSTEMATICS AND EVOLUTION, 2008, 第 1 作者
（32） Hemsleya kunmingensis (Cucurbitaceae), a new species from China, ANNALES BOTANICI FENNICI, 2007, 第 1 作者
（33） Natural hybridization origin of Rhododendron agastum (Ericaceae) in Yunnan, China: inferred from morphological and molecular evidence, JOURNAL OF PLANT RESEARCH, 2007, 第 5 作者
（34） Genetic diversity and geographic differentiation in Tacca chantrieri (Taccaceae): an autonomous selfing plant with showy floral display, ANNALS OF BOTANY, 2006, 第 3 作者
（35） The Application of Four DNA Sequences to Studying Molecular Phylogeny of Camellia (Theaceae), Acta Botanica Yunnanica, 2006, 第 2 作者

   

（ 1 ） 我国轻纺用野生纤维植物资源及纤维特征数据库的构建, 负责人, 国家任务, 2020-01--2024-11
（ 2 ） 植物种质资源基因组数据公共服务平台的构建, 负责人, 中国科学院计划, 2017-01--2021-12
（ 3 ） 重要野生植物种质资源信息共享与iFlora应用服务, 负责人, 国家任务, 2019-01--2024-12
（ 4 ） 油渣果种质资源的收集、评价与发掘, 负责人, 国家任务, 2016-01--2019-12
（ 5 ） 中国科学院关键技术人才, 负责人, 中国科学院计划, 2017-01--2019-12
（ 6 ） 中国常见高等植物DNA条形码数据库公共服务平台建设, 负责人, 中国科学院计划, 2017-01--2018-12
（ 7 ） 雪胆属(Hemsleya Cogn.)的系统重建与分类学修订, 负责人, 国家任务, 2012-01--2015-12
（ 8 ） DNA条形码基础数据采集和标准化2, 负责人, 国家任务, 2013-07--2018-06
（ 9 ） 被子植物系统发育基因组学, 负责人, 中国科学院计划, 2022-01--2026-12
（ 10 ） 生物种质资源数据库和服务体系创建, 负责人, 地方任务, 2021-09--2024-08
（ 11 ） 种质资源管理数据库及共享平台构建, 负责人, 地方任务, 2021-08--2024-07
（ 12 ） 被子植物科级水平系统发育重建与冲突解析, 负责人, 国家任务, 2024-01--2027-12

现指导学生

秦汉韬  博士研究生  071001-植物学  

彭臻  硕士研究生  086000-生物与医药  

陈颖  硕士研究生  086000-生物与医药