刘晓  男  博导  研究员
电子邮件: liuxiao@genomics.cn
通信地址: 广东深圳盐田东海丽景花园
邮政编码: 518083

研究领域

1. 免疫组学的技术开发和应用。

2. 肿瘤的基因组学和病毒整合研究。

招生信息

   
招生专业
071022-基因组学
招生方向
复杂人类疾病的基因组学,免疫组学

教育背景

2012-09--2016-10   哥本哈根大学   博士
2005-09--2008-06   南京大学   硕士
1999-09--2003-06   南京大学   学士

专利与奖励

   
奖励信息
(1) 深圳市海外高层次人才B类, 市地级, 2017
专利成果
( 1 ) MHC 区域核酸文库的构建方法及用途, 发明, 2014, 第 3 作者, 专利号: ZL 201010555724. 4
( 2 ) 一种构建杂交测序文库的方法, 发明, 2014, 第 2 作者, 专利号: ZL 201010299269.6
( 3 ) FFPE 样品核酸文库,其构建方法和FFPE 样品 分析方法, 发明, 2014, 第 2 作者, 专利号: ZL 201010571180. 0
( 4 ) 一种提高原核生物转录组高通量测序效率的方法, 发明, 2014, 第 2 作者, 专利号: ZL 20101060021 1. 0
( 5 ) 用于扩增免疫球蛋白重链CDR3 编码序列的引物组合物及其用途, 发明, 2015, 第 2 作者, 专利号: ZL 201110444740.0
( 6 ) CYP450基因型别数据库及基因分型、酶活性 鉴定方法, 发明, 2017, 第 1 作者, 专利号: ZL 201210002976.3
( 7 ) 构建药物反应相关基因标准型别数据库的 方法及其应用, 发明, 2017, 第 1 作者, 专利号: ZL 201210002898.7
( 8 ) 用于扩增T 细胞受体ß f.连CDR3 编码序列的 引物组合物及其用途, 发明, 2015, 第 2 作者, 专利号: ZL 201210011443.1
( 9 ) 用于扩增T 细胞受体αf连CDR3 编码序列的 引物组合物及其用途, 发明, 2015, 第 2 作者, 专利号: ZL 201210055230.9
( 10 ) 一种检测染色体STS 区域微缺失的方法及其装置, 发明, 2016, 第 1 作者, 专利号: ZL 201280070387.7
( 11 ) 筛选纳米抗体的方法及系统, 发明, 2017, 第 1 作者, 专利号: 201580042224.1
( 12 ) 评价疫苗免疫效果的系统, 发明, 2017, 第 3 作者, 专利号: 201510629695. 4
( 13 ) 确定重排前V/J基因序列的方法和装置, 发明, 2017, 第 4 作者, 专利号: 201610075036.5
( 14 ) 用于淋巴细胞定量检测的标记物和淋巳细 胞定量检测方法, 发明, 2018, 第 3 作者, 专利号: 201610895868.1

出版信息

   
发表论文
(1) A Comprehensive Analysis of the T and B Lymphocytes Repertoire Shaped by HIV Vaccines, Frontiers in Immunology, 2018, 通讯作者
(2) The landscape and diagnostic potential of T and B cell repertoire in Immunoglobulin A Nephropathy, Journal of Autoimmunity, 2018, 通讯作者
(3) History, Applications and challenges of immune repertoire research., Cell Biology and Toxicology, 2018, 通讯作者
(4) Characterization of BCR repertoire in the intestinal mucosa and of tumor-infiltrating lymphocytes in colorectal adenoma and carcinoma., The Journal of Immunology, 2017, 通讯作者
(5) A comprehensive profiling of T- and B-lymphocyte receptor repertoires from a Chinese-origin rhesus macaque by high-throughput sequencing, PLoS ONE, 2017, 通讯作者
(6) The different T-cell receptor repertoires in breast cancer tumors, draining lymph nodes, and adjacent tissues., Cancer Immunology Research, 2016, 通讯作者
(7) IMPre: an accurate and efficient software for prediction of T- and B-cell receptor germline genes and alleles from rearranged repertoire data, Frontiers in Immunology, 2016, 通讯作者
(8) Genomic and oncogenic preference of HBV integration in hepatocellular carcinoma., Nature Communications, 2016, 第 2 作者
(9) Minimal Residual Disease Detection and Evolved IGH Clones Analysis in Acute B Lymphoblastic Leukemia Using IGH Deep Sequencing, Frontiers in Immunology, 2016, 通讯作者
(10) Species specific exome probes reveal new insights in positively selected genes in nonhuman primates, Scientific Reports, 2016, 通讯作者
(11) Comparative Analysis of Immune Repertoires between Bactrian Camel's Conventional and Heavy-Chain Antibodies, PLoS ONE, 2016, 通讯作者
(12) Systematic Comparative Evaluation of Methods for Investigating the TCRβ Repertoire, PLoS ONE, 2016, 第 1 作者
(13) Novel Y-chromosomal microdeletions associated with non-obstructive azoospermia uncovered by high throughput sequencing of sequence-tagged sites (STSs), Scientific Reports, 2016, 第 1 作者
(14) IMonitor: a robust pipeline for TCR and BCR repertoire analysis, Genetics, 2015, 通讯作者
(15) Whole genome sequencing identifies recurrent mutations in hepatocellular carcinoma, Genome Research, 2013, 第 3 作者
(16) Genome-wide survey of recurrent HBV integration in hepatocellular carcinoma, Nature Genetics, 2012, 第 5 作者

科研活动

   
科研项目
( 1 ) 抗原受体基因组测序用于白血病化疗后免疫力恢复评价的, 主持, 省级, 2018-01--2020-12
( 2 ) 抑炎细胞因子对类风湿关节炎的免疫调节机制研究, 主持, 省级, 2018-01--2020-12
( 3 ) 遗传和环境因素交互作用下神经环路的沉默与早期AD发病, 参与, 国家级, 2016-01--2020-12
参与会议
(1)泛免疫组计划及在风湿病领域的应用   全国风湿学学术大会   2018-05-30
(2)the landscape of peripheral T cell repertoire of autoimmune diseases   全国免疫学学术大会   2017-10-25