基本信息
李国庆  男  硕导  中国科学院自动化研究所
电子邮件: guoqing.li@ia.ac.cn
通信地址: 北京市海淀区中关村东路95号自动化大厦207
邮政编码: 100190

研究领域

微观脑图谱(连接组学)描述大脑神经微观连接环路结构,课题组目前瞄准微观图谱成像数据的获取技术,主要通过电子显微镜对超薄脑切片进行三维阵列断层扫描的方式,获得大范围(近毫米级)脑神经微观图谱三维结构的大数据;并结合深度学习等前沿技术,通过降噪、去模糊、超分辨率等超像素算法提升成像效率;同时,联合XRay三维成像方法,光遗传学等技术获取多尺度光电联合三维影像,进而为研究脑神经功能-结构图谱关联提供数据模型支持。

(1)国产高通量微观脑图谱扫描电镜三维影像系统

本课题组负责研发的该型系统,首次提出并实现了在线序列切片精准定位三维数据输出,填补了国内高通量微观脑图谱数据获取的短板。2019年底已完成I型系统的研发,性能指标达到国际先进水平,关键技术同时申请了中国和国际专利(PCT美国),并均已获得授权,研发期间获得自然基金委和中科院院仪器研发项目的支持。同时在北京市科委的项目支持下,开展系统的产业化工作,实现从底层到顶层软硬件“一体化”的高通量数据解决方案。在掌握核心自主知识产权的前提下,该型系统改变我国生物成像高端设备“受制于人”的现状。

图1 已投入使用的小批量集群化的三维影像系统

(2)显微成像系统超分技术研发与应用

近年来,基于深度学习的图像超分算法已得到广泛应用。本课题组主要研发先进的图像(视频)超分算法,同时在时空上提高生物显微成像系统的成像效率。在时间维度上,通过去噪、去模糊等超分算法降低成像设备的像素驻留时间,进而提高成像时间效率;在空间维度上,通过像素超分辨率算法应用,达到空间维度的分辨率提升,进而提高成像效率;本课题组在该领域逐年有相关成果产出。

招生信息

2020年起招收硕士研究生,每年计划招收模式识别与智能系统专业硕士生 2名,方向为显微影像分析,智能成像与分析,扫描电镜在线缺陷检测技术

招生专业
081104-模式识别与智能系统
081203-计算机应用技术
招生方向
高通量扫描电镜成像系统,显微影像分析
智能图像处理与分析,图像超分辨率处理技术
扫描电镜在线缺陷检测技术

教育背景

2007-09--2012-07   中国科学院研究生院   计算机应用技术工学博士学位
2003-09--2007-07   北京交通大学   电子科学与技术工学学士学位
学历

2007.09-2012.07 工学博士,计算机应用技术,中国科学院研究生院,中国,导师:刘波。/Ph.D in Computer Applied Technology, University of Chinese Academy of Sciences,Beijing, China.

2003.09-2007.07 工学学士,电子科学与技术,北京交通大学/B.E in Electronic Science and Technology, Beijing Jiaotong University,Beijing,China.

学位

2007.09-2012.07 工学博士,计算机应用技术,中国科学院研究生院,中国导师:刘波/Ph.D in Computer Applied Technology, University of Chinese Academy of Sciences,Beijing, China.

2003.09-2007.07 工学学士,电子科学与技术,北京交通大学/B.E in Electronic Science and Technology, Beijing Jiaotong University,Beijing,China.

工作经历

2017.10-至今/now 副研究员,中国科学院自动化研究所/Associate Researcher, Institute of Automation, Chinese Academy of Sciences.

2015.04-2017.09 助理研究员,中国科学院自动化研究所/Assistant Researcher, Institute of Automation, Chinese Academy of Sciences.

2014.04-2015.03 高级图像算法工程师,Hermes Micro-vision ltd.(现ASML.HMI),美国圣何塞米尔皮塔斯(硅谷)/Senior Image Algorithm Engineer, Hermes Micro-vision ltd.(CA,USA).

2012.07-2014.03 助理研究员,中国科学院国家空间科学中心/Assistant Researcher, National Space Science Center, CAS.

工作简历
2017-11~现在, 中国科学院自动化研究所, 副研究员
2015-04~2017-10,中国科学院自动化研究所, 助理研究员
2014-04~2015-03,Hermes Micro-vision ltd.(现ASML.HMI), 高级图像算法工程师
2012-07~2014-03,中国科学院国家空间科学中心, 助理研究员
社会兼职
2018-04-16-2020-12-30,科学顾问, 聚束科技(北京)超高速电镜成像与智能分析联合实验室

专利与奖励

   
专利成果
( 1 ) 基于序列切片的显微镜图像采集方法, 发明, 2016, 第 1 作者, 专利号: ZL 2016 1 0978135.4
( 2 ) 一种低能量背散射电子探测器, 发明, 2017, 第 1 作者, 专利号: L 2017 1 0935508.4
( 3 ) Method for Microscopic Image Acquisition Based on Sequential Section, 发明, 2020, 第 1 作者, 专利号: US 10,699,100 B2

出版信息

   
发表论文
(1) Sparse self-attention aggregation networks for neural sequence slice interpolation, BioData Mining, 2021, 通讯作者
(2) A Multi-Scale Wavelet CNN for Scanning Electron Microscopy, ACM Conference Proceedings in ICCPR 2019, 2019, 通讯作者
(3) GAN Based Sample Simulation for SEM-Image Super Resolution, CCCV 2017, 2017, 通讯作者
(4) Morphological De-noising Method in Differential Image for Change Detection, Journal of Convergence Information Technology, 2012, 第 1 作者

科研活动

   
科研项目
( 1 ) 面向超薄序列切片的三维电镜自动成像技术研究, 主持, 国家级, 2018-01--2020-12
( 2 ) 高通量扫描电镜三维影像系统产业化, 主持, 省级, 2018-01--2020-12
参与会议
(1)Microscopic Reconstruction and Analysis Platform for Connectomics in Institute of Automation   Guoqing Li   2019-04-18

合作情况

合作单位

高新企业:

聚束科技(北京)科技有限公司

项目协作单位


指导学生

   
协助指导学生

2015级

杨茂柯  硕士研究生  085211-计算机技术  生源:中南大学 毕业去向:深动科技  现工作单位:深动科技

2016级

赵盼     硕士联培生(哈理工)  085211-计算机技术 生源:青岛科技大学 毕业去向:腾讯(offer)

2018级

王泽锦 硕博研究生  081104-模式识别与智能系统  生源:武汉理工大学

2019级

孙国栋 硕士研究生 081104-模式识别与智能系统  生源:华北电力大学