070703-海洋生物学
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071300-生态学

微生物分子生态
海洋微生物学
环境微生物生态学

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微生物分子生态
海洋微生物学
环境微生物生态学

   

2014-04~现在, 中国科学院深海科学与工程研究所, 研究员
2013-03~2014-03,中国科学院深海科学与工程研究所, 副研究员
2012-02~2013-01,新加坡国立大学土木及环境工程学院, 高级访问学者
2010-06~2010-08,美国伍兹霍海洋生物研究所, 访问科学家
2008-11~2012-01,香港科技大学, 访问学者
2006-11~2008-10,加拿大魁北克大学蒙特利尔分校生物系, 博士后

深海环境与微生物生态系统

   

（1） Evolution and genetic adaptation of fishes to the deep sea, CELL, 2025, 第 14 作者
（2） Deep-Sea Ecosystems as an Unexpected Source of Antibiotic Resistance Genes, MARINE DRUGS, 2025, 第 5 作者  通讯作者
（3） The Vertical Metabolic Activity and Community Structure of Prokaryotes along Different Water Depths in the Kermadec and Diamantina Trenches, MICROORGANISMS, 2024, 第 2 作者  通讯作者
（4） Deterministic process controlling the prokaryotic community assembly across seamounts along in the Yap and Mariana trenches, ECOLOGICAL INDICATORS, 2024, 第 2 作者  通讯作者
（5） Evolutionary ecology of denitrifying methanotrophic NC10 bacteria in the deep-sea biosphere, Molecular Ecology, 2024, 第 3 作者  通讯作者
（6） 海洋暗光层颗粒附着微生物的群落演替和生态功能, Community succession and ecological functions of particle attached microbes in the twilight zone of the ocean, 河南师范大学学报（自然科学版）, 2024, 第 1 作者
（7） Metagenome sequencing and 107 microbial genomes from seamount sediments along the Yap and Mariana trenches, SCIENTIFIC DATA, 2024, 第 2 作者  通讯作者
（8） Chromatic Acclimating Synechococcus Dominate in Mesoscale Eddies, JOURNAL OF GEOPHYSICAL RESEARCH-OCEANS, 2024, 第 6 作者
（9） Microbial communities reveal niche partitioning across the slope and bottom zones of the challenger deep, ENVIRONMENTAL MICROBIOLOGY REPORTS, 2024, 第 6 作者  通讯作者
（10） Comparative assessment of nitrogen fixation rate by ^(15)N_(2) tracer assays in the South China Sea, Comparative assessment of nitrogen fixation rate by ^(15)N_(2) tracer assays in the South China Sea, 海洋学报:英文版, 2023, 第 6 作者
（11） Genomic Insights into Niche Partitioning across Sediment Depth among Anaerobic Methane-Oxidizing Archaea in Global Methane Seeps, MSYSTEMS, 2023, 第 6 作者
（12） 大洋表层沉积物中甲烷代谢古菌群落的组成及分布特征, Composition and distribution of methane metabolic archaea in oceanic surface sediments, 海洋学报, 2023, 第 4 作者
（13） 夏季珠江口冲淡水对氨氧化古菌的空间演替及分布规律的影响, Community structures and activities of ammonia oxidizing archaea influenced by runoff input of Pearl River Estuary during summer, 河南师范大学学报:自然科学版, 2023, 第 1 作者
（14） Archaea predominate in the ammonia oxidation process in the sediments of the Yap and Mariana Trenches, FRONTIERS IN MICROBIOLOGY, 2023, 第 2 作者  通讯作者
（15） Active pathways of anaerobic methane oxidization in deep-sea cold seeps of the South China Sea, MICROBIOLOGY SPECTRUM, 2023, 第 2 作者  通讯作者
（16） Microbial Communities Are Shaped by Different Ecological Processes in Subtropical Reservoirs of Different Trophic States, MICROBIAL ECOLOGY, 2023, 第 6 作者  通讯作者
（17） Geographical distribution and driving force of micro-eukaryotes in the seamount sediments along the island arc of the Yap and Mariana trenches, MICROBIOLOGY SPECTRUM, 2023, 第 5 作者  通讯作者
（18） Global patterns and rates of habitat transitions across the eukaryotic tree of life, NATURE ECOLOGY & EVOLUTION, 2022, 第 5 作者
（19） Distribution and Oxidation Rates of Ammonia-Oxidizing Archaea Influenced by the Coastal Upwelling off Eastern Hainan Island, MICROORGANISMS, 2022, 第 6 作者  通讯作者
（20） Picocyanobacterial synechococcus in marine ecosystem: Insights from genetic diversity, global distribution, and potential function, MARINE ENVIRONMENTAL RESEARCH, 2022, 第 3 作者
（21） Composition and Ecological Roles of the Core Microbiome along the Abyssal-Hadal Transition Zone Sediments of the Mariana Trench, MICROBIOLOGY SPECTRUM, 2022, 第 1 作者  通讯作者
（22） Metabolic activity and community structure of prokaryotes associated with particles in the twilight zone of the South China Sea, FRONTIERS IN MICROBIOLOGY, 2022, 第 4 作者  通讯作者
（23） Insights into carbon-fixation pathways through metagonomics in the sediments of deep-sea cold seeps, MARINE POLLUTION BULLETIN, 2022, 第 2 作者  通讯作者
（24） Biogeography and Population Divergence of Microeukaryotes Associated with Fluids and Chimneys in the Hydrothermal Vents of the Southwest Indian Ocean, MICROBIOLOGY SPECTRUM, 2022, 第 3 作者  通讯作者
（25） Biogeographic distributions of microbial communities associated with anaerobic methane oxidation in the surface sediments of deep-sea cold seeps in the South China Sea, FRONTIERS IN MICROBIOLOGY, 2022, 第 2 作者  通讯作者
（26） Spatio-Temporal Variation of Synechococcus Assemblages at DNA and cDNA Levels in the Tropical Estuarine and Coastal Waters, FRONTIERS IN MICROBIOLOGY, 2022, 第 5 作者  通讯作者
（27） Spatial variation and metabolic diversity of microbial communities in the surface sediments of the Mariana Trench, FRONTIERS IN MICROBIOLOGY, 2022, 第 3 作者  通讯作者
（28） Global patterns and rates of habitat transitions across the eukaryotic tree of life, NATURE ECOLOGY & EVOLUTION, 2022, 第 5 作者
（29） Novel Viral Communities Potentially Assisting in Carbon, Nitrogen, and Sulfur Metabolism in the Upper Slope Sediments of Mariana Trench, MSYSTEMS, 2022, 第 2 作者  通讯作者
（30） Distinct metabolic strategies of the dominant heterotrophic bacterial groups associated with marine Synechococcus, SCIENCE OF THE TOTAL ENVIRONMENT, 2021, 第 6 作者
（31） Effect of river plume on phytoplankton community structure in Zhujiang River estuary, Effect of river plume on phytoplankton community structure in Zhujiang River estuary, JOURNAL OF OCEANOLOGY AND LIMNOLOGY, 2021, 第 8 作者
（32） Microbial Eukaryotes Associated With Sediments in Deep-Sea Cold Seeps, FRONTIERS IN MICROBIOLOGY, 2021, 第 5 作者  通讯作者
（33） Genomic and transcriptomic evidence for the diverse adaptations of subclusters 5.2 and 5.3 Synechococcus to mesoscale eddies, New Phytologist, 2021, 第 1 作者
（34） Geology, environment, and life in the deepest part of the world’s oceans, Geology, environment, and life in the deepest part of the world’s oceans, 创新(英文), 2021, 第 11 作者
（35） Diversity and distribution of viruses inhabiting the deepest ocean on Earth, ISME JOURNAL, 2021, 第 9 作者
（36） Geology, environment and life of the deepest part of the world’s ocean, The Innovation, 2021, 第 3 作者
（37） Anaerobic methane oxidation coupled to denitrification is an important potential methane sink in deep-sea cold seeps, SCIENCE OF THE TOTAL ENVIRONMENT, 2020, 第 1 作者  通讯作者
（38） Vertical shifts of particle-attached and free-living prokaryotes in the water column above the cold seeps of the South China Sea, MARINE POLLUTION BULLETIN, 2020, 第 2 作者  通讯作者
（39） Corrigendum to "Vertical shifts of particle-attached and free-living prokaryotes in the water column above the cold seeps of the South China Sea" Mar. Pollut. Bull. Volume 156, July 2020, 111,230, MARINE POLLUTION BULLETIN, 2020, 第 2 作者  通讯作者
（40） Vertical shifts of particle-attached and free-living prokaryotes in the water column above the cold seeps of the South China Sea (vol 156, 111230, 2020), MARINE POLLUTION BULLETIN, 2020, 第 2 作者  通讯作者
（41） Heterotrophic diazotrophs in a eutrophic temperate bay (Jiaozhou Bay) broadens the domain of N2 fixation in China's coastal waters, ESTUARINE COASTAL AND SHELF SCIENCE, 2020, 第 2 作者
（42） Metabolic response of prokaryotic microbes to sporadic hypoxia in a eutrophic subtropical estuary, MARINE POLLUTION BULLETIN, 2020, 第 2 作者
（43） Differential Distribution and Determinants of Ammonia Oxidizing Archaea Sublineages in the Oxygen Minimum Zone off Costa Rica, MICROORGANISMS, 2019, 第 4 作者
（44） Comparative metagenomics study reveals pollution induced changes of microbial genes in mangrove sediments, SCIENTIFIC REPORTS, 2019, 第 5 作者  通讯作者
（45） Spatial Variability of Picoeukaryotic Communities in the Mariana Trench, SCIENTIFIC REPORTS, 2018, 第 1 作者  通讯作者
（46） 三亚海域浮游病毒与细菌丰度的时空变化规律以及相关环境因子*, Spatiotemporal variations of virioplankton and bacterioplankton abundance in Sanya waters and their related environmental factors, 热带海洋学报, 2018, 第 1 作者
（47） Metagenomic Insights Into the Microbial Community and Nutrient Cycling in the Western Subarctic Pacific Ocean, FRONTIERS IN MICROBIOLOGY, 2018, 第 2 作者
（48） 亚热带和热带环境下夜光藻的摄食压力, Grazing pressure of Noctiluca in subtropical and tropical seas, 应用海洋学学报, 2018, 第 2 作者
（49） Particle-Attached and Free-Living Archaeal Communities in the Benthic Boundary Layer of the Mariana Trench, FRONTIERS IN MICROBIOLOGY, 2018, 第 1 作者  通讯作者
（50） Geographic Distribution of Ammonia-Oxidizing Archaea along the Kuril Islands in the Western Subarctic Pacific, FRONTIERS IN MICROBIOLOGY, 2017, 第 1 作者  通讯作者
（51） Spatial Variations of the Methanogenic Communities in the Sediments of Tropical Mangroves, PLOS ONE, 2016, 第 1 作者
（52） Effects of hypoxia on the phylogenetic composition and species distribution of protists in a subtropical harbor, MICROBIAL ECOLOGY, 2016, 第 2 作者
（53） Effects of intermediate metabolite carboxylic acids of TCA cycle on Microcystis with overproduction of phycocyanin, ENVIRONMENTAL SCIENCE AND POLLUTION RESEARCH, 2015, 第 8 作者
（54） Anthropogenic impact on diazotrophic diversity in the mangrove rhizosphere revealed by nifH pyrosequencing, FRONTIERS IN MICROBIOLOGY, 2015, 第 1 作者  通讯作者
（55） Co-occurrence of phycocyanin- and phycoerythrin-rich synechococcus in subtropical estuarine and coastal waters of hong kong, ENVIRONMENTAL MICROBIOLOGY REPORTS, 2014, 第 2 作者
（56） Vertical Profiles of Bacteria in the Tropical and Subarctic Oceans Revealed by Pyrosequencing, PLOS ONE, 2013, 第 1 作者
（57） Diversity and Spatial Distribution of Hydrazine Oxidoreductase ( hzo ) Gene in the Oxygen Minimum Zone Off Costa Rica, PLOS ONE, 2013, 第 2 作者

（1） 深渊科学 : 地质、环境与生命新前沿, 科学出版社, 2023-03, 第 其他 作者

   

（ 1 ） 深海冷泉微生物驱动的关键甲烷厌氧氧化过程及生态贡献, 负责人, 地方任务, 2024-01--2026-12
（ 2 ） 典型海底流体系统极端生命生态贡献与适应机制, 负责人, 国家任务, 2022-12--2026-11
（ 3 ） 深海新物种快速甄别鉴定及具有潜在致病性新型微生物快速甄别鉴定, 负责人, 地方任务, 2021-12--2024-12
（ 4 ） 南海冷泉区微生物的群落演替特征及在甲烷转化中的作用, 负责人, 地方任务, 2020-12--2023-12
（ 5 ） 南海深海微生态系统的结构与功能研究, 负责人, 地方任务, 2019-12--2023-06
（ 6 ） 深渊微生态系统中的物质流、能量流与信息流, 负责人, 国家任务, 2018-08--2021-12
（ 7 ） 南海暗光层颗粒有机物附着微生物的组成和潜在生态功能 研究, 负责人, 国家任务, 2018-01--2021-12
（ 8 ） 南海环礁潟湖中关键氮循环过程和对海洋酸化的响应, 负责人, 国家任务, 2018-01--2020-12
（ 9 ） 上升流中微生物对氨氧化速率影响的研究, 负责人, 国家任务, 2015-01--2017-12
（ 10 ） 深渊微生物的群落结构与分子生态学研究, 负责人, 中国科学院计划, 2014-01--2018-12
（ 11 ） 热带、亚热带红树林中甲烷氧化还原微生物的组成分布及对甲烷溢出量的调控, 负责人, 中国科学院计划, 2013-09--2017-03

（1）spatiotemporal variation of ammonia oxidizing archaea along the salinity gradient in the pearl river estuary   2017-07-22

海洋微生物分子生态学

   

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2014-04--中国科学院深海科学与工程研究所   研究员
2013-03--2014-03   中国科学院深海科学与工程研究所   副研究员
2012-02--2013-01   新加坡国立大学土木及环境工程学院   高级访问学者
2010-06--2010-08   美国伍兹霍海洋生物研究所   访问科学家
2008-11--2012-01   香港科技大学   访问学者
2006-11--2008-10   加拿大魁北克大学蒙特利尔分校生物系   博士后
2002-09--2006-08   香港大学生态与环境多样性系   博士