1.单细胞多组学数据挖掘与分析方法开发

2.空间转录组技术应用与数据可视化方法开发

3.非编码基因与非编码区遗传变异功能研究

4.基于计算的神经退行性疾病药物发现与精准用药

2003.9-2008.7 哈尔滨医科大学 生物信息学 学士

2008.9-2014.7 中国科学院生物物理研究所 生物信息学 博士

2014.07-2016.12 中国科学院生物物理研究所 高通量测序平台 工程师

2017.01-              中国科学院生物物理研究所 高通量测序平台 高级工程师

奖励信息

1. 2013年 国家奖学金

2. 2019年 中国科学院关键技术人才

3. 2020年 中国科学院教育教学成果一等奖（第三完成人）

4. 2020年 中国科学院大学教育教学成果一等奖（第三完成人）

5. 2021年 中华人民共和国教育部课程思政示范课程、教学名师和教学团队（第三完成人）

专利成果

1. 发明名称：一种针对东亚人群全基因组范围内的非编码区的SNPs的DNA芯片，发明人：陈小伟；陈润生，专利号：ZL201680000526.7

2. 发明名称：一种针对欧洲人群全基因组范围内的非编码区的SNPs的DNA芯片，发明人：陈小伟；陈润生，专利号：ZL201810125333.5

3. 发明名称：一种预测影响长非编码RNA生物学功能的SNP位点的方法，发明人：陈小伟；范珍；陈润生，专利号：ZL201810122529.9

4. 发明名称：基于染色体空间相互作用预测长非编码RNA生物学功能的方法，发明人：范珍；陈小伟；陈润生，专利号：ZL201810082985.5

1. Zhen Fan, Runsheng Chen*, Xiaowei Chen*. (2020). SpatialDB: a database for spatially resolved transcriptomes. Nucleic Acids Research. 48(1):233-237.

2. Zhen Fan^#, Xiaowei Chen^#, Lu Liu^#, …, Yong Cui*, Xuejun Zhang*, Runsheng Chen*. (2020). Association of the Polymorphism rs13259960 in SLEAR With Predisposition to Systemic Lupus Erythematosus. Arthritis & Rheumatology. 72(6):985-996.

3. Xiaowei Chen^#, Yajing Hao^#, Ya Cui^#, Zhen Fan, …, Runsheng Chen*. (2016). LncVar: a database of genetic variation associated with long non-coding genes. Bioinformatics. 33(1),112-118.

4. Xiaowei Chen^#, Zhen Fan^#, …, Runsheng Chen*, Jane Y Wu*. (2018). TDP-43 regulates cancer-associated microRNAs. Protein & cell. 9 (10), 848-866.

5. Xiaowei Chen, Yajing Hao, Ya Cui, Zhen Fan, Runsheng Chen. (2019). LncVar: Deciphering Genetic Variations Associated with Long Noncoding Genes. Epitranscriptomics. 189-198.

6. Ying Wang^#, Xiaowei Chen^#, Zhi-Ping Liu^#, …, Xiang-Sun Zhang*, Runsheng Chen*, Luonan Chen*. (2013) De novo prediction of RNA–protein interactions from sequence information. Molecular BioSystems. 9(1),133-142.

7. Li Liu^#, Xiaowei Chen^#, Geir Skogerbø, Peng Zhang, Runsheng Chen*, Shunmin He*, Da-Wei Huang*. (2012) The human microbiome: a hot spot of microbial horizontal gene transfer. Genomics. 100 (5), 265-270.

8. Ya Cui^#, Xiaowei Chen^#, Huaxia Luo, Zhen Fan, …, Runsheng Chen*. (2016) BioCircos. js: an interactive Circos JavaScript library for biological data visualization on web applications. Bioinformatics. 32(11),11714-11727.

9. Zhen Fan^#, Xiaowei Chen^#, Runsheng Chen*. (2014) Transcriptome-wide analysis of TDP-43 binding small RNAs identifies miR-NID1 (miR-8485), a novel miRNA that represses NRXN1 expression. Genomics. 103 (1), 76-82.

10. Ya Cui^#, Xiaowei Chen^#, Yiwei Niu^#, …, Runsheng Chen*. (2018) Dynamic-BM: multispecies Dynamic BodyMap database from temporal RNA-seq data. Briefings in bioinformatics. 19 (6), 1302-1309.

1. 国家自然科学基金委员会面上项目，系统性红斑狼疮非编码区易感位点的系统发现及功能研究，2019-01至2022-12，项目负责人；

2. 国家自然科学基金委员会青年科学基金项目，非编码基因区遗传变异识别及生物学功能挖掘，2018-01至2020-12，项目负责人；

3. 国家高科技研究发展计划（863计划），微生物组学数据集成及分析的关键技术研发，2014-01至2016-12，子课题负责人；

4. 云计算关键技术与应用北京市重点实验室开放课题，基于全基因组关联分析数据的疾病风险基因挖掘及应用，2016-06至2017-06，项目负责人。